120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1757 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  100 
 
 		 205 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  97.56 
 
 		 205 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  86.34 
 
 		 200 aa  333  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  56.99 
 
 		 192 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  59.49 
 
 		 196 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  60 
 
 		 196 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  53.47 
 
 		 231 aa  205  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  55.98 
 
 		 195 aa  201  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  55.38 
 
 		 195 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  55.38 
 
 		 194 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  55.87 
 
 		 196 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  56.28 
 
 		 194 aa  198  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  54.26 
 
 		 198 aa  198  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  55.38 
 
 		 195 aa  198  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  56.67 
 
 		 195 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  52.97 
 
 		 194 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  52.97 
 
 		 194 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  52.97 
 
 		 194 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  52.97 
 
 		 194 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  52.97 
 
 		 194 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  58.29 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  53.81 
 
 		 195 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  52.28 
 
 		 195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  52.28 
 
 		 195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  51.78 
 
 		 195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  52.28 
 
 		 195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  52.28 
 
 		 195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  52.28 
 
 		 195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  52.28 
 
 		 195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  52.28 
 
 		 195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  57.14 
 
 		 195 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  55.85 
 
 		 194 aa  194  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  55.85 
 
 		 194 aa  194  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  55.85 
 
 		 194 aa  194  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  51.26 
 
 		 195 aa  194  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  51.76 
 
 		 195 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  52.79 
 
 		 195 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  52.79 
 
 		 195 aa  193  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  56 
 
 		 194 aa  193  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  52.79 
 
 		 195 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  52.79 
 
 		 195 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  56 
 
 		 194 aa  193  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  52.31 
 
 		 194 aa  192  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  57.14 
 
 		 188 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  57.14 
 
 		 188 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  55.81 
 
 		 195 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  52.28 
 
 		 195 aa  191  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  51.5 
 
 		 194 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  53.5 
 
 		 194 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  51.28 
 
 		 195 aa  165  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3754  putative lipoprotein  52.63 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  44.97 
 
 		 188 aa  131  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0557  putative lipoprotein  43.02 
 
 		 167 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  39.6 
 
 		 185 aa  124  9e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  39.47 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  40.64 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2091  twin-arginine translocation pathway signal  42.38 
 
 		 186 aa  115  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0577412  hitchhiker  0.0000798401 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2672  hypothetical protein  38.12 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  38.93 
 
 		 187 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1352  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  37.58 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  39.6 
 
 		 186 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  42.17 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  38.06 
 
 		 189 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  38.06 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  38.06 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2325  twin-arginine translocation pathway signal  33.5 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00153358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  34.62 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2684  twin-arginine translocation pathway signal  33.5 
 
 		 197 aa  95.5  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.407299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  33.53 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  32.37 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  32.16 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  32.94 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  31.72 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  32.61 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  37.14 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  32.85 
 
 		 257 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  33.83 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  37.69 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  27.54 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  35 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1331  hypothetical protein  38.82 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  28.89 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  33.59 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  28.46 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  31.54 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  31.88 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  29.08 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  32.82 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  31.54 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  30.32 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  27.91 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  28.12 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  28.12 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  30.67 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  29.76 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0234  hypothetical protein  33.83 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0232  hypothetical protein  33.83 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  25.76 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  25.87 
 
 		 267 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  37.8 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>