120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4453 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  100 
 
 		 196 aa  387  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  94.39 
 
 		 196 aa  339  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  75.51 
 
 		 198 aa  299  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  67.35 
 
 		 195 aa  270  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  66.33 
 
 		 195 aa  267  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  66.84 
 
 		 195 aa  266  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  70.92 
 
 		 195 aa  263  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  65.82 
 
 		 195 aa  261  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  65.46 
 
 		 195 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  65.31 
 
 		 195 aa  257  9e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  65.31 
 
 		 195 aa  257  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  65.31 
 
 		 195 aa  257  9e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  65.31 
 
 		 195 aa  257  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  65.31 
 
 		 195 aa  257  9e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  65.31 
 
 		 195 aa  257  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  65.31 
 
 		 195 aa  257  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  65.46 
 
 		 195 aa  256  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  64.8 
 
 		 195 aa  255  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  64.95 
 
 		 194 aa  248  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  64.95 
 
 		 194 aa  248  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  64.95 
 
 		 194 aa  248  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  64.95 
 
 		 194 aa  248  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  64.95 
 
 		 194 aa  248  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  63.27 
 
 		 195 aa  248  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  64.43 
 
 		 194 aa  248  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  65.98 
 
 		 196 aa  245  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  61.73 
 
 		 195 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  61.73 
 
 		 195 aa  244  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  61.73 
 
 		 195 aa  244  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  61.73 
 
 		 195 aa  244  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  63.92 
 
 		 194 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  66.14 
 
 		 188 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  66.14 
 
 		 188 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  60.71 
 
 		 195 aa  241  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  67.42 
 
 		 194 aa  238  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  62.37 
 
 		 194 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  62.37 
 
 		 194 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  62.37 
 
 		 194 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  62.24 
 
 		 195 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  60.71 
 
 		 194 aa  235  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  60.71 
 
 		 194 aa  234  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  59.79 
 
 		 192 aa  233  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  62.92 
 
 		 200 aa  222  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  55.56 
 
 		 231 aa  218  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  59.49 
 
 		 205 aa  214  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  57.14 
 
 		 195 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  57.95 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  52.82 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  54.31 
 
 		 194 aa  202  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  52.55 
 
 		 194 aa  193  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3754  putative lipoprotein  58.72 
 
 		 194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  43.42 
 
 		 191 aa  140  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0557  putative lipoprotein  48.5 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  42.77 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2672  hypothetical protein  43.04 
 
 		 183 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1352  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  40.91 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2325  twin-arginine translocation pathway signal  45.03 
 
 		 191 aa  127  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00153358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  42.16 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  41.72 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  45.03 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  45.03 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  45.03 
 
 		 185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  44.16 
 
 		 190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2091  twin-arginine translocation pathway signal  37.5 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0577412  hitchhiker  0.0000798401 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  39.08 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  34.16 
 
 		 187 aa  108  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  36.81 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2684  twin-arginine translocation pathway signal  36.25 
 
 		 197 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.407299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  34.21 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  39.42 
 
 		 233 aa  72  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  36.76 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  35.61 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  38.3 
 
 		 230 aa  67.8  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  36.57 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  39.1 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  29.65 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  28.42 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  35.11 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  32.84 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  29.88 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  36.84 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  29.27 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  32.12 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  27.74 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1170  hypothetical protein  34.48 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.215934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  26.87 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  29.01 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  33.85 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  31.25 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  32.94 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  36.27 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  34.11 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  33.83 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3682  hypothetical protein  31.48 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  30.83 
 
 		 229 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  28.87 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  33.79 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  30.6 
 
 		 249 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  28.18 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1331  hypothetical protein  33.6 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>