96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4764 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  525  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  50.78 
 
 
231 aa  210  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  47.92 
 
 
274 aa  202  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  41.57 
 
 
231 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  41.01 
 
 
231 aa  152  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  39.02 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  37.67 
 
 
225 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  37.75 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  36.08 
 
 
230 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  36.71 
 
 
301 aa  139  6e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  38.32 
 
 
222 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  37.29 
 
 
233 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  36.71 
 
 
301 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  37.75 
 
 
297 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  39.39 
 
 
222 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1181  hypothetical protein  37.44 
 
 
238 aa  132  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  33.5 
 
 
233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  38.07 
 
 
230 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3682  hypothetical protein  34.38 
 
 
219 aa  123  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2464  hypothetical protein  36.18 
 
 
225 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96143  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  42.18 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  32.2 
 
 
209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  39.41 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59246  predicted protein  34.83 
 
 
399 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.518781 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0886  protein of unknown function DUF500  30.06 
 
 
221 aa  104  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  32.69 
 
 
229 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04168  DUF500 and SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07880)  31.13 
 
 
410 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  33.9 
 
 
230 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01250  conserved hypothetical protein  38.65 
 
 
242 aa  94.4  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0232  hypothetical protein  34.39 
 
 
217 aa  93.6  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0234  hypothetical protein  34.39 
 
 
217 aa  93.6  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  26.77 
 
 
242 aa  93.2  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1499  hypothetical protein  29.31 
 
 
228 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  30.93 
 
 
327 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1385  hypothetical protein  25.1 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1381  hypothetical protein  27.27 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0802704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  29.83 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  31.52 
 
 
249 aa  79  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00830  conserved hypothetical protein  32.04 
 
 
663 aa  78.2  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0732  putative secreted protein  28.06 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0525  putative secreted protein  28.06 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02236  DUF500 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07310)  30.48 
 
 
604 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217493  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48746  predicted protein  27.61 
 
 
556 aa  68.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  38.46 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3410  protein of unknown function DUF500  27.68 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10288  conserved hypothetical protein  30.38 
 
 
362 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  30.56 
 
 
196 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44183  predicted protein  26.46 
 
 
1316 aa  56.6  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125536  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  26.83 
 
 
231 aa  56.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  28.47 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  28.15 
 
 
195 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  29.79 
 
 
195 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  32.7 
 
 
189 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  26.76 
 
 
194 aa  52.4  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2672  hypothetical protein  34.57 
 
 
183 aa  52.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2091  twin-arginine translocation pathway signal  29.17 
 
 
186 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0577412  hitchhiker  0.0000798401 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  29.85 
 
 
190 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  28.16 
 
 
195 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  30.66 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1331  hypothetical protein  29.32 
 
 
188 aa  50.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  29.57 
 
 
187 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  29.2 
 
 
195 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  31.5 
 
 
187 aa  48.9  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  28.7 
 
 
188 aa  48.5  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2325  twin-arginine translocation pathway signal  29.88 
 
 
191 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00153358  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1874  hypothetical protein  26.72 
 
 
188 aa  48.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31168  predicted protein  25.35 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0146707  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1352  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.73 
 
 
190 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04590  actin filament organization-related protein, putative  29.48 
 
 
522 aa  47.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  27.27 
 
 
196 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  26.98 
 
 
192 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  31.86 
 
 
195 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  27.19 
 
 
195 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  25.17 
 
 
200 aa  45.8  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  25.56 
 
 
198 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  25.32 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  29.81 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  27.61 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  27.61 
 
 
189 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3754  putative lipoprotein  38.46 
 
 
194 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  27.59 
 
 
185 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  24.8 
 
 
194 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  24.8 
 
 
194 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  24.8 
 
 
194 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  24.8 
 
 
188 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  24.8 
 
 
194 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  24.8 
 
 
194 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  24.8 
 
 
188 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  27.19 
 
 
195 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  29.41 
 
 
194 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  29.41 
 
 
194 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  29.41 
 
 
194 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1170  hypothetical protein  32.86 
 
 
201 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.215934  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  25.32 
 
 
205 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  25.32 
 
 
205 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  27.73 
 
 
194 aa  42.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>