77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2464 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2464  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  450  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96143  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1181  hypothetical protein  44.55 
 
 
238 aa  186  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  39.29 
 
 
274 aa  138  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  36.32 
 
 
231 aa  134  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  36.18 
 
 
260 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  39.68 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  36.45 
 
 
222 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  35.42 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  34.39 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  37.37 
 
 
231 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  34.39 
 
 
301 aa  108  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  36.36 
 
 
231 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  37.3 
 
 
299 aa  105  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  32.6 
 
 
230 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  34.04 
 
 
233 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  33.8 
 
 
225 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  35.48 
 
 
230 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  38.67 
 
 
236 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  32.35 
 
 
225 aa  98.6  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  31.36 
 
 
230 aa  98.2  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  34.66 
 
 
297 aa  97.4  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  29.83 
 
 
229 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  31.16 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  34.07 
 
 
233 aa  89.4  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0886  protein of unknown function DUF500  29.23 
 
 
221 aa  84.7  9e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1499  hypothetical protein  27.36 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  28.37 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  30.67 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  32.28 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3682  hypothetical protein  30.14 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04168  DUF500 and SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07880)  33.33 
 
 
410 aa  78.6  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10288  conserved hypothetical protein  32.39 
 
 
362 aa  75.5  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3410  protein of unknown function DUF500  31.71 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  31.35 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01250  conserved hypothetical protein  35.67 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0234  hypothetical protein  29.38 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0232  hypothetical protein  29.38 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59246  predicted protein  30.69 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.518781 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1381  hypothetical protein  27.81 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0802704  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02236  DUF500 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07310)  28.18 
 
 
604 aa  64.7  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217493  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48746  predicted protein  29.55 
 
 
556 aa  59.7  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1331  hypothetical protein  32.56 
 
 
188 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  33.02 
 
 
188 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  30.07 
 
 
187 aa  55.5  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  32.78 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00830  conserved hypothetical protein  27.36 
 
 
663 aa  52  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  35.61 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1385  hypothetical protein  22.28 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  30.49 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  31.08 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  34.48 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  30.4 
 
 
186 aa  49.7  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  34.09 
 
 
196 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  34.26 
 
 
195 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0525  putative secreted protein  22.66 
 
 
246 aa  49.3  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0732  putative secreted protein  22.66 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  35.11 
 
 
194 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  32.35 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  31.82 
 
 
200 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  30 
 
 
190 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2684  twin-arginine translocation pathway signal  29.94 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.407299  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  37.5 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2091  twin-arginine translocation pathway signal  32.53 
 
 
186 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0577412  hitchhiker  0.0000798401 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  33.12 
 
 
195 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  32.58 
 
 
195 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  34.15 
 
 
195 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  37.5 
 
 
198 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  30.77 
 
 
205 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  33.33 
 
 
196 aa  45.1  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  30.07 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  27.78 
 
 
188 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  32.76 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  28.21 
 
 
189 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1399  hypothetical protein  27.78 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44183  predicted protein  23.9 
 
 
1316 aa  42  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125536  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5219  hypothetical protein  25.36 
 
 
188 aa  41.6  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.307666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>