42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44183 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_44183  predicted protein  100 
 
 
1316 aa  2707    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125536  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04168  DUF500 and SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07880)  38.46 
 
 
410 aa  121  9e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59246  predicted protein  34.62 
 
 
399 aa  115  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.518781 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48746  predicted protein  33.17 
 
 
556 aa  102  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3682  hypothetical protein  33.48 
 
 
219 aa  101  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10288  conserved hypothetical protein  32.99 
 
 
362 aa  98.6  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01250  conserved hypothetical protein  34 
 
 
242 aa  94.7  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02236  DUF500 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07310)  32.85 
 
 
604 aa  91.7  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217493  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00830  conserved hypothetical protein  31.17 
 
 
663 aa  91.3  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  28.12 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04590  actin filament organization-related protein, putative  26.98 
 
 
522 aa  78.2  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  30.29 
 
 
222 aa  72.8  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  29.57 
 
 
222 aa  72.4  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  29.61 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  28.65 
 
 
231 aa  71.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  26.83 
 
 
257 aa  69.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  25.42 
 
 
230 aa  66.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  27.53 
 
 
231 aa  65.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  28.81 
 
 
209 aa  65.9  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  27 
 
 
230 aa  65.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  28.81 
 
 
230 aa  61.6  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  29.38 
 
 
242 aa  61.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  25.56 
 
 
260 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  27.04 
 
 
233 aa  55.1  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1181  hypothetical protein  26.56 
 
 
238 aa  55.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  22.22 
 
 
301 aa  54.3  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  24.18 
 
 
231 aa  54.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  22.22 
 
 
301 aa  53.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  26.09 
 
 
229 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  27.16 
 
 
267 aa  52  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3410  protein of unknown function DUF500  26.55 
 
 
279 aa  52  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  23.39 
 
 
299 aa  50.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  24.31 
 
 
297 aa  49.3  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0732  putative secreted protein  24.5 
 
 
246 aa  48.5  0.0009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0525  putative secreted protein  24.5 
 
 
246 aa  48.5  0.0009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1499  hypothetical protein  23.74 
 
 
228 aa  47.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0232  hypothetical protein  25.43 
 
 
217 aa  48.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0234  hypothetical protein  25.43 
 
 
217 aa  48.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  22.04 
 
 
225 aa  48.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  24.65 
 
 
225 aa  47  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0886  protein of unknown function DUF500  24.81 
 
 
221 aa  47  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  26.23 
 
 
327 aa  45.1  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>