43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND04590 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND04590  actin filament organization-related protein, putative  100 
 
 
522 aa  1061    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02236  DUF500 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07310)  41.44 
 
 
604 aa  213  7.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217493  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01250  conserved hypothetical protein  38.21 
 
 
242 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59246  predicted protein  40.11 
 
 
399 aa  125  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.518781 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04168  DUF500 and SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07880)  39.78 
 
 
410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3682  hypothetical protein  40.34 
 
 
219 aa  113  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00830  conserved hypothetical protein  35.9 
 
 
663 aa  107  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  37.14 
 
 
230 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10288  conserved hypothetical protein  35.37 
 
 
362 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44183  predicted protein  31.5 
 
 
1316 aa  99.8  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  34.67 
 
 
257 aa  98.6  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  35.85 
 
 
233 aa  95.9  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  36.72 
 
 
231 aa  92.8  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  36.72 
 
 
231 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48746  predicted protein  34.04 
 
 
556 aa  90.5  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  37.78 
 
 
297 aa  86.7  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0886  protein of unknown function DUF500  32.65 
 
 
221 aa  82  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  36.3 
 
 
299 aa  82.4  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  32.2 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  35.86 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  33.91 
 
 
231 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  35.17 
 
 
222 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  31.07 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  34.72 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  37.14 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  33.11 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  32.65 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  34.81 
 
 
301 aa  73.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  33.1 
 
 
274 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  32.23 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  29.48 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  28.25 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1181  hypothetical protein  31.07 
 
 
238 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  29.38 
 
 
229 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  32.11 
 
 
242 aa  62.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1499  hypothetical protein  29.73 
 
 
228 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  29.71 
 
 
209 aa  61.6  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  29.78 
 
 
249 aa  56.6  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0234  hypothetical protein  30.47 
 
 
217 aa  51.6  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0232  hypothetical protein  30.47 
 
 
217 aa  51.6  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2464  hypothetical protein  28.86 
 
 
225 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96143  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  25.15 
 
 
327 aa  47.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  33.33 
 
 
194 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0746601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>