115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2073 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  100 
 
 
222 aa  441  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  95.05 
 
 
222 aa  424  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  56.25 
 
 
257 aa  259  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  57.27 
 
 
231 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  56.82 
 
 
231 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  49.75 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  50.25 
 
 
230 aa  207  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  49.28 
 
 
301 aa  206  3e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  49.28 
 
 
301 aa  205  6e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  49.51 
 
 
299 aa  202  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  50.55 
 
 
297 aa  193  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  44.24 
 
 
274 aa  159  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  40 
 
 
231 aa  156  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  44.09 
 
 
225 aa  156  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  43.78 
 
 
236 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  40.93 
 
 
233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3682  hypothetical protein  44.5 
 
 
219 aa  149  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0886  protein of unknown function DUF500  33.85 
 
 
221 aa  144  9e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59246  predicted protein  45.3 
 
 
399 aa  144  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.518781 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1181  hypothetical protein  40 
 
 
238 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  39.39 
 
 
260 aa  137  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  36.36 
 
 
230 aa  134  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  34.52 
 
 
209 aa  133  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0234  hypothetical protein  39.07 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0232  hypothetical protein  39.07 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  37.5 
 
 
230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  35.11 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04168  DUF500 and SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07880)  39.78 
 
 
410 aa  118  9e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1499  hypothetical protein  32.81 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2464  hypothetical protein  36.6 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96143  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  41.55 
 
 
225 aa  112  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  35.03 
 
 
242 aa  112  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  35.68 
 
 
267 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  36.36 
 
 
327 aa  101  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01250  conserved hypothetical protein  37.72 
 
 
242 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10288  conserved hypothetical protein  38.71 
 
 
362 aa  93.6  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  34.39 
 
 
194 aa  93.6  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00830  conserved hypothetical protein  40.67 
 
 
663 aa  92.8  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  29.94 
 
 
249 aa  91.7  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0525  putative secreted protein  37.09 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0732  putative secreted protein  37.09 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48746  predicted protein  35.62 
 
 
556 aa  88.2  9e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3410  protein of unknown function DUF500  30.25 
 
 
279 aa  85.9  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1385  hypothetical protein  29.38 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1381  hypothetical protein  30.77 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0802704  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02236  DUF500 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07310)  27.53 
 
 
604 aa  76.3  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217493  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44183  predicted protein  30.29 
 
 
1316 aa  72.4  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125536  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1331  hypothetical protein  33.08 
 
 
188 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  34.59 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  37.31 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  36.84 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  35 
 
 
205 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  34.33 
 
 
200 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  35.07 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  32.56 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  34.29 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  28.8 
 
 
187 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1399  hypothetical protein  37.68 
 
 
195 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  31.5 
 
 
231 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  35.07 
 
 
196 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  33.83 
 
 
195 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  32.84 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  33.08 
 
 
195 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  30 
 
 
186 aa  55.8  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  35.82 
 
 
195 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  36.57 
 
 
195 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04590  actin filament organization-related protein, putative  39.05 
 
 
522 aa  55.1  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  32.84 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31168  predicted protein  26.45 
 
 
255 aa  53.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0146707  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  33.96 
 
 
195 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  37.5 
 
 
191 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  36.27 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  32.33 
 
 
198 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  30.83 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  29.1 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  29.85 
 
 
194 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  29.85 
 
 
194 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  31.58 
 
 
194 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  29.85 
 
 
194 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  29.85 
 
 
188 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  29.85 
 
 
194 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  29.85 
 
 
194 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  29.85 
 
 
188 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  29.1 
 
 
194 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  29.1 
 
 
194 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  29.1 
 
 
194 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0557  putative lipoprotein  32.03 
 
 
167 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  29.1 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  29.1 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  30.88 
 
 
194 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  26.51 
 
 
185 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  29.87 
 
 
187 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  28.72 
 
 
188 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  34.26 
 
 
195 aa  46.2  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2684  twin-arginine translocation pathway signal  31.01 
 
 
197 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.407299  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  29.85 
 
 
186 aa  45.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  28.89 
 
 
195 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  27.27 
 
 
194 aa  45.1  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  32.71 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  32.71 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>