67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3410 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3410  protein of unknown function DUF500  100 
 
 
279 aa  552  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  45.69 
 
 
242 aa  185  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  35.91 
 
 
225 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  35.55 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  32.34 
 
 
222 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  31.65 
 
 
297 aa  99.8  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  29.08 
 
 
301 aa  99.8  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  30.83 
 
 
274 aa  99.8  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  28.29 
 
 
301 aa  97.4  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  32.95 
 
 
299 aa  97.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  28.5 
 
 
257 aa  95.9  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1181  hypothetical protein  30.18 
 
 
238 aa  95.9  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  30.13 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  29.35 
 
 
222 aa  93.2  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  25 
 
 
209 aa  92.4  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  29.06 
 
 
231 aa  89.7  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  30.56 
 
 
230 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  32.37 
 
 
231 aa  87  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  29.15 
 
 
233 aa  86.3  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  29.15 
 
 
230 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  27.09 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  31.65 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  32.64 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  27.4 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2464  hypothetical protein  31.71 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96143  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  24.65 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  24.7 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  29.68 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0886  protein of unknown function DUF500  25 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  27.53 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1499  hypothetical protein  28.4 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02236  DUF500 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07310)  25.97 
 
 
604 aa  67.4  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217493  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0234  hypothetical protein  24.61 
 
 
217 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0232  hypothetical protein  24.61 
 
 
217 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44183  predicted protein  26.24 
 
 
1316 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125536  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  30.3 
 
 
194 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59246  predicted protein  26.06 
 
 
399 aa  55.5  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.518781 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3682  hypothetical protein  26.88 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1399  hypothetical protein  30.3 
 
 
195 aa  53.1  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10288  conserved hypothetical protein  24.29 
 
 
362 aa  52.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1331  hypothetical protein  25.77 
 
 
188 aa  52.4  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48746  predicted protein  25.83 
 
 
556 aa  52.8  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1381  hypothetical protein  23.28 
 
 
221 aa  52  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0802704  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0732  putative secreted protein  23.15 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01250  conserved hypothetical protein  25 
 
 
242 aa  49.7  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  29.46 
 
 
198 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0525  putative secreted protein  22.96 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04168  DUF500 and SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07880)  28.12 
 
 
410 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1385  hypothetical protein  22.54 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  24.35 
 
 
187 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 
186 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  30.53 
 
 
205 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  26.47 
 
 
231 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  26.88 
 
 
188 aa  46.6  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  26.67 
 
 
200 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  29.01 
 
 
205 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2684  twin-arginine translocation pathway signal  30.05 
 
 
197 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.407299  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  24.47 
 
 
190 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  29.61 
 
 
185 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  24.42 
 
 
195 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  24.42 
 
 
195 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  24.42 
 
 
195 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  24.42 
 
 
195 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  24.42 
 
 
195 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  24.42 
 
 
195 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  24.42 
 
 
195 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  29.23 
 
 
192 aa  42.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>