99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3454 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  467  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  53.93 
 
 
274 aa  223  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  50.78 
 
 
260 aa  211  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  45.41 
 
 
231 aa  177  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  44.93 
 
 
231 aa  175  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1181  hypothetical protein  39.22 
 
 
238 aa  175  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  46.07 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  36.84 
 
 
301 aa  162  6e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  36.84 
 
 
301 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  38.71 
 
 
230 aa  159  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  40.5 
 
 
222 aa  157  9e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  40 
 
 
222 aa  156  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  42.02 
 
 
233 aa  151  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  40.33 
 
 
297 aa  149  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  39.11 
 
 
225 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  39.31 
 
 
299 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3682  hypothetical protein  38.5 
 
 
219 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  32.83 
 
 
209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2464  hypothetical protein  35.78 
 
 
225 aa  131  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96143  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  37.97 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  42.42 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  35.35 
 
 
233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  32.88 
 
 
225 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  36.51 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  37.57 
 
 
229 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1499  hypothetical protein  32.76 
 
 
228 aa  109  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04168  DUF500 and SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07880)  37.91 
 
 
410 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  34.1 
 
 
242 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01250  conserved hypothetical protein  35.48 
 
 
242 aa  107  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59246  predicted protein  38.29 
 
 
399 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.518781 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0232  hypothetical protein  32.99 
 
 
217 aa  105  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0234  hypothetical protein  32.99 
 
 
217 aa  105  7e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0886  protein of unknown function DUF500  31.79 
 
 
221 aa  103  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  30.99 
 
 
327 aa  92.8  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  31.19 
 
 
249 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  30.57 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00830  conserved hypothetical protein  31.88 
 
 
663 aa  85.5  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02236  DUF500 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07310)  32.58 
 
 
604 aa  85.5  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217493  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48746  predicted protein  31.74 
 
 
556 aa  84.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3410  protein of unknown function DUF500  28.27 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1381  hypothetical protein  29.44 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0802704  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0732  putative secreted protein  30.63 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0525  putative secreted protein  30.63 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10288  conserved hypothetical protein  30.87 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  33.77 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1331  hypothetical protein  28.66 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  34.85 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1385  hypothetical protein  26.11 
 
 
220 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  35.29 
 
 
195 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  34.06 
 
 
196 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  30.66 
 
 
194 aa  62.4  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1399  hypothetical protein  28.57 
 
 
195 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  29.55 
 
 
205 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  28.89 
 
 
205 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  34.09 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  31.11 
 
 
196 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  30.23 
 
 
231 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  25.81 
 
 
200 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  32.35 
 
 
196 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  29.63 
 
 
195 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  28.15 
 
 
192 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04590  actin filament organization-related protein, putative  32.6 
 
 
522 aa  55.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2091  twin-arginine translocation pathway signal  30.22 
 
 
186 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0577412  hitchhiker  0.0000798401 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2672  hypothetical protein  34.07 
 
 
183 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  31.68 
 
 
185 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44183  predicted protein  23.91 
 
 
1316 aa  53.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125536  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  27.22 
 
 
189 aa  52  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  28.89 
 
 
195 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31168  predicted protein  26.88 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0146707  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  28 
 
 
194 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  28 
 
 
194 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  25.81 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  25.81 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  28 
 
 
194 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  25.81 
 
 
194 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  31.62 
 
 
187 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  25.81 
 
 
194 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  25.81 
 
 
194 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  25.81 
 
 
194 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  25.81 
 
 
194 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  27.03 
 
 
195 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  27.41 
 
 
195 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  26.17 
 
 
194 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  25.16 
 
 
194 aa  48.5  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  28.06 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  27.27 
 
 
195 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  25.76 
 
 
194 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  24.67 
 
 
194 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  25.78 
 
 
185 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  24 
 
 
194 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  26.32 
 
 
194 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  26.15 
 
 
188 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  26.32 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0557  putative lipoprotein  28.8 
 
 
167 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  29.41 
 
 
187 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  24.24 
 
 
195 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  27.27 
 
 
182 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  24.24 
 
 
194 aa  41.6  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>