96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2347 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  547  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  51.83 
 
 
231 aa  231  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  47.92 
 
 
260 aa  202  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1181  hypothetical protein  44.93 
 
 
238 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  42.21 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  44.09 
 
 
231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  43.92 
 
 
231 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  41.05 
 
 
230 aa  162  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  43.55 
 
 
233 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  42.7 
 
 
222 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  39.63 
 
 
257 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  40.39 
 
 
301 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  40.39 
 
 
301 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  44.79 
 
 
299 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  41.85 
 
 
297 aa  149  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  36.97 
 
 
209 aa  142  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  38.1 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  37.8 
 
 
225 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2464  hypothetical protein  39.29 
 
 
225 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96143  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  33.96 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  36.22 
 
 
233 aa  125  6e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3682  hypothetical protein  36.92 
 
 
219 aa  122  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  36.73 
 
 
236 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  34.7 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0234  hypothetical protein  36.98 
 
 
217 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0232  hypothetical protein  36.98 
 
 
217 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59246  predicted protein  35.47 
 
 
399 aa  106  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.518781 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0886  protein of unknown function DUF500  33.73 
 
 
221 aa  105  9e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  38.02 
 
 
267 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  32.8 
 
 
229 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  32.57 
 
 
230 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1499  hypothetical protein  29.21 
 
 
228 aa  98.2  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04168  DUF500 and SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07880)  36.31 
 
 
410 aa  98.2  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  36.96 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01250  conserved hypothetical protein  32.8 
 
 
242 aa  90.5  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3410  protein of unknown function DUF500  30.77 
 
 
279 aa  88.2  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00830  conserved hypothetical protein  33.5 
 
 
663 aa  88.6  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1381  hypothetical protein  25.68 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0802704  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  30 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02236  DUF500 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07310)  29.27 
 
 
604 aa  80.1  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217493  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0525  putative secreted protein  28.17 
 
 
246 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0732  putative secreted protein  27.56 
 
 
246 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10288  conserved hypothetical protein  31.55 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1331  hypothetical protein  30.39 
 
 
188 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48746  predicted protein  29.47 
 
 
556 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1385  hypothetical protein  24.19 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  29.37 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  32.81 
 
 
200 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  34.59 
 
 
198 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  33.83 
 
 
205 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  33.33 
 
 
205 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  32.03 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  32 
 
 
187 aa  59.3  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  33.08 
 
 
194 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31168  predicted protein  32.14 
 
 
255 aa  58.9  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0146707  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  35.09 
 
 
186 aa  57  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  33.04 
 
 
188 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  33.59 
 
 
195 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  35.56 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  33.83 
 
 
196 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  32.32 
 
 
196 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  32.86 
 
 
195 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1399  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  50.4  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  33.96 
 
 
190 aa  50.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  34.65 
 
 
195 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  28.42 
 
 
194 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2091  twin-arginine translocation pathway signal  30.1 
 
 
186 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0577412  hitchhiker  0.0000798401 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  32.14 
 
 
195 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  32.06 
 
 
195 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  25.78 
 
 
192 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  25.78 
 
 
187 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  31.54 
 
 
195 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_006686  CND04590  actin filament organization-related protein, putative  35.11 
 
 
522 aa  46.6  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  30.23 
 
 
195 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  29.46 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5219  hypothetical protein  29.01 
 
 
188 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.307666 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  31.01 
 
 
195 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  28.68 
 
 
195 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  28.68 
 
 
194 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  28.46 
 
 
194 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  28.68 
 
 
182 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  28.68 
 
 
194 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  29.01 
 
 
194 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  29.01 
 
 
194 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  29.01 
 
 
194 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  29.01 
 
 
194 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  29.46 
 
 
194 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  29.01 
 
 
194 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  29.01 
 
 
188 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  29.01 
 
 
188 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  29.46 
 
 
194 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  29.46 
 
 
194 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  29.46 
 
 
194 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  23.73 
 
 
189 aa  42.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0557  putative lipoprotein  31.54 
 
 
167 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  24.18 
 
 
191 aa  42.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>