48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1499 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1499  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  465  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  31.53 
 
 
222 aa  122  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  31.08 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  30.58 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  30.96 
 
 
257 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  32.4 
 
 
233 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  32 
 
 
297 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  31.68 
 
 
230 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  32 
 
 
299 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  31.91 
 
 
231 aa  102  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  32.35 
 
 
236 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  30.98 
 
 
231 aa  101  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  32.14 
 
 
301 aa  99.8  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  32.14 
 
 
301 aa  99.8  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  29.21 
 
 
274 aa  98.2  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  30.39 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0886  protein of unknown function DUF500  26.98 
 
 
221 aa  95.5  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01250  conserved hypothetical protein  33.51 
 
 
242 aa  94  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  27.39 
 
 
229 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3682  hypothetical protein  29.26 
 
 
219 aa  90.5  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04168  DUF500 and SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07880)  35.03 
 
 
410 aa  89  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  29.31 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1181  hypothetical protein  26.84 
 
 
238 aa  85.5  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2464  hypothetical protein  27.36 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96143  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  28.11 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  27.72 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  26.94 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59246  predicted protein  30.43 
 
 
399 aa  79  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.518781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  31.28 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  31 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  26.05 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1385  hypothetical protein  26.09 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  26.86 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  30 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  24.77 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  26.84 
 
 
327 aa  68.9  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3410  protein of unknown function DUF500  29.17 
 
 
279 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02236  DUF500 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07310)  26.97 
 
 
604 aa  63.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217493  normal  0.0410821 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10288  conserved hypothetical protein  25.91 
 
 
362 aa  63.5  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1381  hypothetical protein  25.85 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0802704  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31168  predicted protein  27.17 
 
 
255 aa  59.7  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0146707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0232  hypothetical protein  26.84 
 
 
217 aa  55.8  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0234  hypothetical protein  26.84 
 
 
217 aa  55.8  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0732  putative secreted protein  22.86 
 
 
246 aa  54.3  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0525  putative secreted protein  22.86 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00830  conserved hypothetical protein  30.19 
 
 
663 aa  53.9  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48746  predicted protein  22.67 
 
 
556 aa  53.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44183  predicted protein  22.73 
 
 
1316 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>