109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0591 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
185 aa  371  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  60.45 
 
 
185 aa  211  7e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2672  hypothetical protein  57.71 
 
 
183 aa  197  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  63.64 
 
 
186 aa  193  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  51.23 
 
 
187 aa  186  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2091  twin-arginine translocation pathway signal  49.1 
 
 
186 aa  162  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0577412  hitchhiker  0.0000798401 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2684  twin-arginine translocation pathway signal  45.66 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.407299  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  40.61 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  39.66 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  38.66 
 
 
195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  41.61 
 
 
194 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  41.61 
 
 
194 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  41.61 
 
 
194 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  41.61 
 
 
194 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  41.61 
 
 
194 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  39.38 
 
 
195 aa  124  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  41.61 
 
 
188 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  41.61 
 
 
188 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  38.33 
 
 
194 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  44 
 
 
196 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  38.92 
 
 
231 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  41.72 
 
 
198 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  39.63 
 
 
194 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  39.63 
 
 
194 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  39.63 
 
 
194 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  42 
 
 
196 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  37.66 
 
 
200 aa  121  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  37.31 
 
 
195 aa  121  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  40.37 
 
 
194 aa  121  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  40.37 
 
 
194 aa  121  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  40.74 
 
 
195 aa  120  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  37.31 
 
 
195 aa  120  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  41.33 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  38.25 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  41.45 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  40.72 
 
 
194 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  37.31 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  37.31 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  37.31 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  37.31 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  37.31 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  37.31 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  37.31 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  36.27 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  36.27 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  36.27 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  40.37 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  39.74 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  36.27 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  38.89 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  35.75 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1352  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  37.5 
 
 
190 aa  115  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  34.86 
 
 
191 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  36.46 
 
 
188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  37.2 
 
 
192 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  37.5 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  37.5 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  40.13 
 
 
189 aa  108  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  35.26 
 
 
194 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  33.33 
 
 
194 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  33.52 
 
 
194 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  36.93 
 
 
185 aa  98.2  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  36.88 
 
 
189 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  36.88 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  40.3 
 
 
190 aa  95.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2325  twin-arginine translocation pathway signal  37.89 
 
 
191 aa  94.4  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00153358  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3754  putative lipoprotein  32.5 
 
 
194 aa  80.9  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0557  putative lipoprotein  36.29 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  38.17 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  27.18 
 
 
233 aa  62  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  35.66 
 
 
186 aa  59.3  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  28.72 
 
 
222 aa  57.8  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  33.09 
 
 
242 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  28.79 
 
 
231 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  31.29 
 
 
194 aa  55.5  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  30.43 
 
 
301 aa  55.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  30.43 
 
 
301 aa  55.5  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1331  hypothetical protein  35.8 
 
 
188 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  26.49 
 
 
222 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  36.21 
 
 
249 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  27.51 
 
 
230 aa  52  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3682  hypothetical protein  29.57 
 
 
219 aa  52  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  28.57 
 
 
178 aa  52  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  25.57 
 
 
225 aa  51.6  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  29.77 
 
 
225 aa  51.2  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1874  hypothetical protein  26.37 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  30.56 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  30.47 
 
 
297 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  31.06 
 
 
229 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  24.86 
 
 
299 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  25 
 
 
257 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  32.22 
 
 
187 aa  48.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  30.3 
 
 
230 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0249  hypothetical protein  24.43 
 
 
177 aa  47.8  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00691872  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  27.75 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  26.22 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  29.63 
 
 
188 aa  45.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  27.78 
 
 
274 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0234  hypothetical protein  36.49 
 
 
217 aa  43.9  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>