70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_59246 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_59246  predicted protein  100 
 
 
399 aa  801    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.518781 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04168  DUF500 and SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07880)  51.21 
 
 
410 aa  363  3e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00830  conserved hypothetical protein  57.58 
 
 
663 aa  204  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01250  conserved hypothetical protein  52.5 
 
 
242 aa  189  5e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3682  hypothetical protein  51.69 
 
 
219 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10288  conserved hypothetical protein  47.95 
 
 
362 aa  159  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  45.3 
 
 
222 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02236  DUF500 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07310)  39.33 
 
 
604 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217493  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  44.81 
 
 
222 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48746  predicted protein  33.62 
 
 
556 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  40.7 
 
 
231 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  40.2 
 
 
231 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  42.54 
 
 
257 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  37.91 
 
 
230 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  36.32 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  35.79 
 
 
301 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44183  predicted protein  34.62 
 
 
1316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125536  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  37.65 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  35.23 
 
 
297 aa  113  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  42.35 
 
 
236 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  37.21 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  38.22 
 
 
233 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  33.9 
 
 
230 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  34.83 
 
 
260 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  34.78 
 
 
274 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  36.78 
 
 
231 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  36.71 
 
 
225 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  35.16 
 
 
230 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1181  hypothetical protein  36.68 
 
 
238 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0886  protein of unknown function DUF500  35.85 
 
 
221 aa  99.4  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04590  actin filament organization-related protein, putative  38.98 
 
 
522 aa  95.1  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  30.81 
 
 
229 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  33.93 
 
 
225 aa  84  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0234  hypothetical protein  35.62 
 
 
217 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0232  hypothetical protein  35.62 
 
 
217 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1499  hypothetical protein  30.94 
 
 
228 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  29.45 
 
 
209 aa  77  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  33.54 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03420  Hob1p, putative  48.28 
 
 
433 aa  74.7  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.233643  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  33.55 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31168  predicted protein  30.3 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0146707  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07760  SH3 domain signalling protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07670)  54.9 
 
 
455 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448426  normal  0.219006 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67177  predicted protein  40.24 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02516  actin-associated protein (Eurofung)  51.92 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.219609  normal  0.718086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  28.25 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  30.72 
 
 
249 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2464  hypothetical protein  30.69 
 
 
225 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96143  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30020  predicted protein  45.76 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.201529  normal  0.620116 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02066  Class E vacuolar protein-sorting machinery protein hse1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBL4]  42.47 
 
 
581 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0525  putative secreted protein  31.67 
 
 
246 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0732  putative secreted protein  31.67 
 
 
246 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1385  hypothetical protein  31.72 
 
 
220 aa  55.8  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00910  glycosyl transferase, putative  40 
 
 
660 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03630  protein binding protein, putative  35.71 
 
 
1978 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.326559  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40822  predicted protein  26.67 
 
 
333 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.519721  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80641  predicted protein  37.18 
 
 
606 aa  50.8  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  34.62 
 
 
195 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3410  protein of unknown function DUF500  27.1 
 
 
279 aa  50.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04880  hypothetical protein  45.1 
 
 
693 aa  50.1  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.693409  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02590  phospholipid binding protein, putative  44.23 
 
 
1053 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1381  hypothetical protein  29.3 
 
 
221 aa  49.3  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0802704  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11147  conserved hypothetical protein  44.44 
 
 
118 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000131571 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02130  cell division control protein Cdc25, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16240)  40.74 
 
 
1241 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  37.23 
 
 
194 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0746601 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08210  SH3 domain protein (Cyk3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03400)  35.71 
 
 
1789 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321233  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29646  predicted protein  41.51 
 
 
618 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0379511 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02995  SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G08620)  36.84 
 
 
253 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04963  cell division control protein (Cdc15), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10250)  36.21 
 
 
1057 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00898549  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73961  predicted protein  37.33 
 
 
1325 aa  43.5  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.828275  normal  0.279842 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35740  predicted protein  34.04 
 
 
702 aa  43.5  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.906927  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>