102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3182 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  100 
 
 		 231 aa  457  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  90.04 
 
 		 231 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  59.74 
 
 		 257 aa  275  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  57.27 
 
 		 222 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  57.27 
 
 		 222 aa  258  7e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  51.11 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  50.98 
 
 		 233 aa  221  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  50.8 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  50.27 
 
 		 301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  49.74 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  52.98 
 
 		 297 aa  188  7e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  44.93 
 
 		 231 aa  174  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  44.5 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  46.24 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  45.29 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1181  hypothetical protein  42.5 
 
 		 238 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  41.57 
 
 		 260 aa  154  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  39.57 
 
 		 230 aa  147  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59246  predicted protein  40.2 
 
 		 399 aa  137  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.518781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  37.13 
 
 		 230 aa  134  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3682  hypothetical protein  36.32 
 
 		 219 aa  133  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  36.41 
 
 		 233 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0886  protein of unknown function DUF500  33.67 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  32.89 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  35.5 
 
 		 209 aa  125  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0234  hypothetical protein  38.62 
 
 		 217 aa  122  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0232  hypothetical protein  38.62 
 
 		 217 aa  122  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04168  DUF500 and SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07880)  39.78 
 
 		 410 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  33.53 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2464  hypothetical protein  36.93 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1499  hypothetical protein  32.73 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  35.42 
 
 		 267 aa  98.2  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  34.68 
 
 		 327 aa  98.2  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  34.46 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01250  conserved hypothetical protein  33.51 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1385  hypothetical protein  28.83 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1381  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0802704  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  32.4 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0732  putative secreted protein  29.41 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0525  putative secreted protein  29.41 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3410  protein of unknown function DUF500  32.37 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00830  conserved hypothetical protein  33.86 
 
 		 663 aa  79.7  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  40.91 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48746  predicted protein  34.94 
 
 		 556 aa  79  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  32.84 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10288  conserved hypothetical protein  33.11 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02236  DUF500 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07310)  28.9 
 
 		 604 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217493  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44183  predicted protein  28.65 
 
 		 1316 aa  68.9  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125536  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  36.8 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  34.85 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04590  actin filament organization-related protein, putative  35.23 
 
 		 522 aa  62.4  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  31.88 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1331  hypothetical protein  28.16 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  31.88 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1399  hypothetical protein  31.18 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  38.24 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  33.59 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  36.3 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  32.06 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  31.62 
 
 		 195 aa  52  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  26.85 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  29.3 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  28.69 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  31.25 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  30.39 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  30.33 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  33.83 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  28.14 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  33.08 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  32.56 
 
 		 182 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  26.52 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  33.94 
 
 		 194 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  33.94 
 
 		 194 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  27.72 
 
 		 178 aa  46.2  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  33.94 
 
 		 194 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  33.94 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  33.94 
 
 		 194 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  33.94 
 
 		 194 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  33.94 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  33.08 
 
 		 195 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0557  putative lipoprotein  30.58 
 
 		 167 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5219  hypothetical protein  27.94 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.307666 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31168  predicted protein  25.93 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0146707  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12081  hypothetical protein  38.46 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.525189  normal  0.755265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  31.54 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1874  hypothetical protein  28.46 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  24.04 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1170  hypothetical protein  27.78 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.215934  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  28.24 
 
 		 178 aa  43.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  31.25 
 
 		 194 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  25.79 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 		 185 aa  42.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  31.19 
 
 		 194 aa  42  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  30 
 
 		 195 aa  42  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  30 
 
 		 195 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  30 
 
 		 195 aa  42  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  30 
 
 		 195 aa  42  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  30 
 
 		 195 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  30 
 
 		 195 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>