110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5219 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5219  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  373  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.307666 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  60.95 
 
 		 186 aa  209  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1279  hypothetical protein  68.45 
 
 		 188 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  50.54 
 
 		 190 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  49.73 
 
 		 187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  47.37 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0256  hypothetical protein  51.37 
 
 		 192 aa  170  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal  0.0986563 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3651  hypothetical protein  47.92 
 
 		 193 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0322  hypothetical protein  48.44 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0293  hypothetical protein  47.4 
 
 		 193 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3847  hypothetical protein  47.4 
 
 		 193 aa  164  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0402  hypothetical protein  53.89 
 
 		 193 aa  162  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4069  hypothetical protein  49.21 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4044  hypothetical protein  49.21 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4162  hypothetical protein  49.21 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3967  hypothetical protein  49.21 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0283  hypothetical protein  51.87 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3665  hypothetical protein  48.63 
 
 		 194 aa  157  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.821634  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3329  hypothetical protein  52.6 
 
 		 191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3541  hypothetical protein  51.83 
 
 		 181 aa  141  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.193134 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2313  hypothetical protein  39.39 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00418629  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15731  hypothetical protein  51.28 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.448321 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1170  hypothetical protein  46.99 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.215934  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1874  hypothetical protein  37.57 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  35.64 
 
 		 178 aa  121  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12081  hypothetical protein  46.15 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.525189  normal  0.755265 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  39.18 
 
 		 178 aa  114  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0249  hypothetical protein  37.57 
 
 		 177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00691872  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2288  hypothetical protein  36.65 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  41.38 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0162  hypothetical protein  37.84 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  29.29 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  28.83 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  30.13 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  29.03 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  30.13 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  27.1 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  27.1 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  24.03 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  29.49 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  30.28 
 
 		 257 aa  51.6  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  26.45 
 
 		 195 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  28.39 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  33.98 
 
 		 267 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  26.92 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  30.91 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  26.92 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  26.92 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  26.62 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  27.56 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  26.92 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  26.92 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  30.61 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  26.45 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  23.87 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  23.87 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  28.97 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  25.16 
 
 		 196 aa  48.5  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  26.92 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  26.92 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  26.92 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  26.92 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  31.53 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  23.87 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  23.87 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  28.97 
 
 		 185 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  23.87 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  23.87 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  23.87 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  26.92 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  26.92 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  26.92 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  28.97 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  28.12 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  30.56 
 
 		 222 aa  47.8  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  26.37 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  31.87 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  27.92 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  26.25 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  28.37 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  26.87 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  25.64 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  31.73 
 
 		 274 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  28.43 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  26.45 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  26.28 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  25.93 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  25.83 
 
 		 185 aa  44.7  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  27.52 
 
 		 260 aa  44.7  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  29.86 
 
 		 222 aa  44.7  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  26.01 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>