93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3808 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  381  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  62.09 
 
 		 185 aa  218  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  64.02 
 
 		 185 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  64.02 
 
 		 189 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1352  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  53.16 
 
 		 190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2325  twin-arginine translocation pathway signal  49.73 
 
 		 191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00153358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  48.39 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  40.62 
 
 		 195 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  43.04 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  42.86 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  41.15 
 
 		 195 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  41.61 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  42.37 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  42.02 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  39.58 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  39.77 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  40.34 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  39.77 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  39.77 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  39.77 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  39.77 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  39.77 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  39.77 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  40.93 
 
 		 195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  39.58 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  39.58 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  39.58 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  40.36 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  39.58 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  39.58 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  39.58 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  40.93 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  40.93 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  39.58 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  39.67 
 
 		 194 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  40.93 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  41.62 
 
 		 196 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  41.99 
 
 		 192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  40.11 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  40.11 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  40.11 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  38.86 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  38.86 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  40.41 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  40 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  42.29 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  37.31 
 
 		 195 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  38.76 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  39.49 
 
 		 195 aa  111  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  42.05 
 
 		 196 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  38.76 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  41.71 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  39.59 
 
 		 231 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  43.05 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  39.31 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  38.18 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  38.41 
 
 		 195 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2672  hypothetical protein  36.31 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  33.85 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3754  putative lipoprotein  44 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  35.06 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  29.19 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  37.59 
 
 		 186 aa  91.7  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  33.53 
 
 		 194 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2091  twin-arginine translocation pathway signal  32 
 
 		 186 aa  84.7  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0577412  hitchhiker  0.0000798401 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  40.3 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2684  twin-arginine translocation pathway signal  36.36 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.407299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0557  putative lipoprotein  39.84 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  30.54 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  26.35 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  31.85 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  33.33 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  31.37 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  28.42 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  27.73 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  31.33 
 
 		 233 aa  49.7  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2288  hypothetical protein  26.29 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  33.7 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  38.24 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  25.44 
 
 		 257 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1874  hypothetical protein  26.28 
 
 		 188 aa  47.8  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5219  hypothetical protein  26.37 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.307666 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  35.82 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1331  hypothetical protein  30.47 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  31.62 
 
 		 327 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0249  hypothetical protein  24.84 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00691872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2313  hypothetical protein  26.76 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00418629  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  23.2 
 
 		 222 aa  45.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  24.81 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  25.27 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  22.4 
 
 		 222 aa  42  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  34.74 
 
 		 249 aa  41.2  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  29.3 
 
 		 231 aa  41.2  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>