More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1611 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03520  conserved hypothetical protein  77.49 
 
 		 452 aa  704    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1611  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 433 aa  880    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.585379  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0978  major facilitator transporter  74.6 
 
 		 435 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3361  putative hexuronate transporter  74.6 
 
 		 435 aa  665    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3599  major facilitator transporter  75.7 
 
 		 435 aa  665    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03471  hypothetical protein  77.49 
 
 		 452 aa  704    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2353  major facilitator superfamily MFS_1  81.52 
 
 		 436 aa  742    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0926  putative hexuronate transporter  74.6 
 
 		 435 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1642  major facilitator superfamily MFS_1  87.07 
 
 		 432 aa  761    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.3142  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1313  major facilitator transporter  80.28 
 
 		 433 aa  728    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.720769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  81.29 
 
 		 436 aa  738    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  47.16 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  46.92 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  46.25 
 
 		 435 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  45.69 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  46.39 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  44.44 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  45.28 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 423 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  44.21 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  44.44 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  44.44 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  44.44 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  44.44 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  42.51 
 
 		 432 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  43 
 
 		 472 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  43 
 
 		 472 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  43 
 
 		 432 aa  354  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  42.27 
 
 		 433 aa  353  5e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 430 aa  352  8e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  42.65 
 
 		 434 aa  352  8e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  42.65 
 
 		 434 aa  352  8e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  42.65 
 
 		 433 aa  352  8e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  42.03 
 
 		 433 aa  351  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3547  d-galactonate transporter  42.89 
 
 		 474 aa  349  5e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.48586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3386  d-galactonate transporter  42.17 
 
 		 434 aa  348  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  42.51 
 
 		 432 aa  346  4e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  42.03 
 
 		 433 aa  345  7e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0608  d-galactonate transporter  42.75 
 
 		 432 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3385  hexuronate transporter  42.75 
 
 		 432 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4408  hexuronate transporter  42.75 
 
 		 432 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.591703 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0607  d-galactonate transporter  42.75 
 
 		 432 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3276  putative hexuronate transporter  42.75 
 
 		 432 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  43.17 
 
 		 425 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  43.17 
 
 		 425 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  43.21 
 
 		 429 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  43.3 
 
 		 411 aa  334  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0935  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 427 aa  334  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.881993  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5219  MFS transporter, phthalate permease family  42.58 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0325  general substrate transporter:TonB box, N-terminal  42.89 
 
 		 436 aa  319  7e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000282343  normal  0.265981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  39.62 
 
 		 433 aa  308  8e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 430 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  34.76 
 
 		 433 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 441 aa  207  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 431 aa  199  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  28.93 
 
 		 424 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  32.93 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 441 aa  196  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 442 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 430 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  32.2 
 
 		 480 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  31.93 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 436 aa  189  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 		 426 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  31.1 
 
 		 442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 424 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 445 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 420 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  31 
 
 		 441 aa  179  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 431 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 430 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 430 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 430 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 430 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 435 aa  173  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  26.13 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 429 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 449 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 439 aa  166  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 442 aa  166  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 429 aa  166  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>