107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0959 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  100 
 
 		 69 aa  142  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  47.54 
 
 		 71 aa  70.5  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  50.82 
 
 		 62 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  52.46 
 
 		 62 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  56.14 
 
 		 62 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  52.46 
 
 		 62 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  56.14 
 
 		 62 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  57.89 
 
 		 62 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  50.82 
 
 		 62 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  56.14 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  49.18 
 
 		 62 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1562  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  50.82 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  45.16 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  49.18 
 
 		 62 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  47.54 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  46.67 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  47.37 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  45 
 
 		 62 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  45 
 
 		 62 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  45 
 
 		 62 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  45 
 
 		 61 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  44.26 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  43.33 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  47.54 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  49.12 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  47.37 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  47.37 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0020  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.33 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  44.64 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1082  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.121221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30590  4-oxalocrotonate isomerase; LapI  45.45 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000000517706  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.59 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  38.18 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.33 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.82 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.67 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.36 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.36 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.1 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3818  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.275708  normal  0.0206899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.36 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0810  4-oxalocrotonate tautomerase  36.92 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0804  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2180  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1510  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 		 61 aa  43.9  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.258565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0911  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4596  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 66 aa  43.5  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 66 aa  43.5  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0086  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6264  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 		 63 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113457  normal  0.380962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1805  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1741  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.112491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.5 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3103  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1317  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 		 63 aa  42  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702276  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0702  putative isomerase  35.09 
 
 		 61 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.995375  normal  0.17203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1290  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 67 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1751  4-oxalocrotonate tautomerase  35.19 
 
 		 137 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00944027  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1368  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848687  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2951  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.86 
 
 		 76 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0740  4-oxalocrotonate tautomerase  28.57 
 
 		 59 aa  41.2  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000705367 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0652  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.360531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.25 
 
 		 244 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3763  4-oxalocrotonate tautomerase  31.58 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  31.58 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  26.87 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3425  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  30 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.93 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0471  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>