103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_08790 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
63 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08690  4-oxalocrotonate tautomerase  80 
 
 
60 aa  103  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1317  4-oxalocrotonate tautomerase  60.32 
 
 
63 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702276  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2957  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 
63 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426421  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3617  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 
128 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629202  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 
63 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.87442 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 
63 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  53.97 
 
 
63 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  50.79 
 
 
63 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3523  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0522964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5353  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167902  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  52.38 
 
 
63 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5081  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.218107 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2498  4-oxalocrotonate tautomerase  49.21 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0252029  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 
63 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 
63 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2158  4-oxalocrotonate tautomerase  53.57 
 
 
127 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  60 
 
 
70 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  50.79 
 
 
63 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  50.79 
 
 
63 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0325  putative tautomerase  46.03 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  50 
 
 
68 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30590  4-oxalocrotonate isomerase; LapI  40.32 
 
 
69 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000000517706  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  50.91 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  49.09 
 
 
69 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1562  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.55 
 
 
62 aa  57.8  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  46.03 
 
 
64 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
70 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1481  4-oxalocrotonate tautomerase  52.46 
 
 
65 aa  55.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2408  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
70 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  42.11 
 
 
71 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2036  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.35 
 
 
71 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 
62 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0471  4-oxalocrotonate tautomerase  31.58 
 
 
68 aa  47  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
62 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 
61 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
62 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3763  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  32.26 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0740  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
59 aa  45.4  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000705367 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  32.26 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  32.26 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.29 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1084  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00458844  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  40.62 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4207  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  43.1 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  30.36 
 
 
63 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.14 
 
 
61 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  39.39 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 
62 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1079  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
60 aa  43.5  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.222536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
62 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
62 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.71 
 
 
67 aa  43.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  29.51 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  41.38 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.07 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0538  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.7 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  28.57 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  41.38 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.71 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.71 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  40.62 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.07 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  39.06 
 
 
67 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  35.38 
 
 
71 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  39.06 
 
 
67 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  36.67 
 
 
76 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  39.66 
 
 
67 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8512  hypothetical protein  39.62 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>