108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0663 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 62 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  93.44 
 
 		 62 aa  120  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  93.44 
 
 		 62 aa  120  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  90.32 
 
 		 62 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  90.32 
 
 		 62 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  88.33 
 
 		 63 aa  113  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  86.67 
 
 		 63 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  85 
 
 		 63 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  75.41 
 
 		 62 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  75.41 
 
 		 62 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  72.13 
 
 		 62 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  65.57 
 
 		 62 aa  97.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  67.21 
 
 		 62 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  65.57 
 
 		 62 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  65 
 
 		 62 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  65 
 
 		 62 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  66.67 
 
 		 62 aa  93.6  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  65 
 
 		 62 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  63.33 
 
 		 62 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  61.67 
 
 		 62 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  61.67 
 
 		 61 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  60 
 
 		 61 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  57.38 
 
 		 63 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  51.67 
 
 		 61 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  49.18 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1562  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  44.26 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0609  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.869247 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  50 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  41.82 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  45 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.64 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.64 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6264  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113457  normal  0.380962 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1139  4-oxalocrotonate tautomerase  50.88 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.374345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.82 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0471  4-oxalocrotonate tautomerase  32.26 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  45.61 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  41.94 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.82 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 		 71 aa  50.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40 
 
 		 64 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3872  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0020  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  41.07 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0086  4-oxalocrotonate tautomerase  32.26 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0804  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  47.4  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.26 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.5 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.5 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4596  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.6 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30590  4-oxalocrotonate isomerase; LapI  37.1 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000000517706  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0208  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08690  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  29.03 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  29.51 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6040  4-oxalocrotonate tautomerase  47.06 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.868812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1741  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.112491 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.26 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.7 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0593  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  27.87 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  35.71 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  30.65 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  30.91 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  35.09 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1290  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 		 67 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  30.36 
 
 		 65 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2957  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1634  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1368  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>