105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1809 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
63 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  82.54 
 
 
63 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  82.54 
 
 
63 aa  114  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  88.33 
 
 
62 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  85 
 
 
62 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  85 
 
 
62 aa  110  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  87.93 
 
 
62 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  87.93 
 
 
62 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  70.97 
 
 
62 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  70.97 
 
 
62 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  67.74 
 
 
62 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  67.74 
 
 
62 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  66.13 
 
 
62 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  64.52 
 
 
62 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  59.68 
 
 
62 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  61.67 
 
 
62 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  61.67 
 
 
62 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  61.67 
 
 
62 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  61.67 
 
 
62 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  60 
 
 
61 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  58.33 
 
 
62 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  58.33 
 
 
61 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  53.33 
 
 
63 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  56.14 
 
 
69 aa  64.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.33 
 
 
61 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  44.64 
 
 
63 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.86 
 
 
64 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1562  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40 
 
 
62 aa  53.9  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
61 aa  53.9  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6264  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
63 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113457  normal  0.380962 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0471  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
68 aa  52.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4596  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
63 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  41.07 
 
 
63 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.07 
 
 
63 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.86 
 
 
63 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.07 
 
 
63 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0609  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 
62 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.869247 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0020  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 
71 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
61 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3872  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  41.82 
 
 
71 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1139  4-oxalocrotonate tautomerase  41.27 
 
 
62 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.374345  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  45 
 
 
61 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.68 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.67 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0804  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  39.06 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  39.68 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  39.68 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  39.68 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.68 
 
 
68 aa  47  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 
70 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.68 
 
 
68 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30590  4-oxalocrotonate isomerase; LapI  37.5 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000000517706  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40 
 
 
64 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.07 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
63 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.1 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3103  4-oxalocrotonate tautomerase  31.58 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2957  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426421  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  39.29 
 
 
67 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 
65 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0829  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 
67 aa  41.6  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.51 
 
 
67 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3810  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 
144 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00543847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  38.1 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1082  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 
62 aa  41.2  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.121221  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3425  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  29.82 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0208  4-oxalocrotonate tautomerase  32.76 
 
 
59 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1317  4-oxalocrotonate tautomerase  30.91 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702276  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1634  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
58 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2158  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 
127 aa  41.2  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08690  4-oxalocrotonate tautomerase  37.25 
 
 
60 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0593  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 
61 aa  40.4  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3195  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  29.82 
 
 
157 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.699111  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  30.36 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>