118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_45080 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
71 aa  142  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  77.94 
 
 
68 aa  111  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  86.15 
 
 
67 aa  110  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  80.3 
 
 
66 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  78.79 
 
 
66 aa  107  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  78.79 
 
 
66 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  78.46 
 
 
76 aa  107  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  76.12 
 
 
68 aa  105  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  82.54 
 
 
67 aa  104  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  75 
 
 
67 aa  104  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  76.12 
 
 
67 aa  104  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  82.54 
 
 
67 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  80 
 
 
67 aa  104  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  75 
 
 
67 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2346  4-oxalocrotonate tautomerase  69.57 
 
 
73 aa  98.2  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  79.69 
 
 
67 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  78.12 
 
 
67 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  78.12 
 
 
67 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  78.12 
 
 
67 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  69.23 
 
 
67 aa  94  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  64.18 
 
 
68 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  70.77 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  69.7 
 
 
81 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  65.15 
 
 
71 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  68.75 
 
 
66 aa  89.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3415  4-oxalocrotonate tautomerase  70.15 
 
 
74 aa  88.2  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  61.76 
 
 
69 aa  88.2  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  65.62 
 
 
68 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  61.76 
 
 
68 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  57.75 
 
 
76 aa  85.1  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  65.67 
 
 
72 aa  84  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  60.94 
 
 
65 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  56.06 
 
 
69 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  56.06 
 
 
69 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  51.47 
 
 
69 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1472  hypothetical protein  50.7 
 
 
71 aa  73.9  0.0000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  52.78 
 
 
73 aa  73.6  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  53.52 
 
 
78 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4145  4-oxalocrotonate tautomerase  48.05 
 
 
78 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.711569  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  54.69 
 
 
72 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  51.56 
 
 
73 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  52.38 
 
 
72 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0857  hypothetical protein  47.69 
 
 
76 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0818  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  47.3 
 
 
76 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3995  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 
72 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3914  4-oxalocrotonate tautomerase  46.48 
 
 
79 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  47.37 
 
 
78 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6827  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
78 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  50 
 
 
61 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  39.13 
 
 
71 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  39.68 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2113  hypothetical protein  41.79 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  41.27 
 
 
62 aa  51.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  41.94 
 
 
62 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  44.64 
 
 
62 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  44.64 
 
 
62 aa  50.4  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 
63 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 
63 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
62 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  42.19 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 
62 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
62 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
62 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  39.68 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
62 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
62 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0859  hypothetical protein  29.85 
 
 
67 aa  47  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.14 
 
 
69 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
62 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
62 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 
61 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
62 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  34.92 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  42.11 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3818  4-oxalocrotonate tautomerase  39.13 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.275708  normal  0.0206899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1993  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130331 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
62 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.86 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.86 
 
 
63 aa  43.5  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  39.06 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3312  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0319  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  39.29 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.11 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.11 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6264  4-oxalocrotonate tautomerase  34.38 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113457  normal  0.380962 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  40.62 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 
127 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.483341  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>