85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2575 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
81 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  74.6 
 
 
67 aa  98.6  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3415  4-oxalocrotonate tautomerase  67.12 
 
 
74 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  69.84 
 
 
67 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  69.84 
 
 
66 aa  93.6  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  69.84 
 
 
66 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  66.67 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  68.25 
 
 
66 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  69.7 
 
 
71 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  69.84 
 
 
67 aa  92  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2346  4-oxalocrotonate tautomerase  60.27 
 
 
73 aa  91.3  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  68.25 
 
 
67 aa  90.1  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  66.67 
 
 
67 aa  90.1  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  66.67 
 
 
67 aa  89.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  55.71 
 
 
71 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  66.67 
 
 
67 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  66.67 
 
 
67 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  66.67 
 
 
67 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  65.08 
 
 
76 aa  87  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  62.9 
 
 
66 aa  87  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  66.67 
 
 
67 aa  86.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  65.08 
 
 
67 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  65.08 
 
 
68 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  63.49 
 
 
67 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  55.56 
 
 
69 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  61.9 
 
 
68 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  53.97 
 
 
68 aa  81.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  53.62 
 
 
69 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  53.62 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  58.73 
 
 
68 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  57.58 
 
 
72 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  56.06 
 
 
68 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  49.32 
 
 
73 aa  76.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  55.56 
 
 
65 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  55.56 
 
 
72 aa  73.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 
69 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  50.72 
 
 
72 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  53.85 
 
 
76 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3995  4-oxalocrotonate tautomerase  53.97 
 
 
72 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1472  hypothetical protein  47.89 
 
 
71 aa  67.8  0.00000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  48.57 
 
 
73 aa  67  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 
78 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  44.74 
 
 
78 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0857  hypothetical protein  43.08 
 
 
76 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4145  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 
78 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.711569  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0818  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  44.74 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3914  4-oxalocrotonate tautomerase  43.66 
 
 
79 aa  60.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6827  4-oxalocrotonate tautomerase  36.49 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4257  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  41.54 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 
63 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0859  hypothetical protein  30.51 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.33 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0609  4-oxalocrotonate tautomerase  31.75 
 
 
62 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.869247 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2113  hypothetical protein  36.51 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 
71 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2693  4-oxalocrotonate tautomerase  37.33 
 
 
75 aa  43.5  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.46733 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  38.1 
 
 
63 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4438  4-oxalocrotonate tautomerase  27.27 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0297  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  35.59 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0319  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  35.59 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3425  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  34.78 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3427  4-oxalocrotonate tautomerase  27.27 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  37.93 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  36.21 
 
 
71 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3262  4-oxalocrotonate tautomerase  27.27 
 
 
72 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
62 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  34.92 
 
 
64 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4901  4-oxalocrotonate tautomerase  27.27 
 
 
72 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3195  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  34.78 
 
 
157 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.699111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3103  4-oxalocrotonate tautomerase  34.78 
 
 
157 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
62 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3448  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  34.78 
 
 
157 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1700  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  34.43 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  31.75 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5607  4-oxalocrotonate tautomerase  33.8 
 
 
70 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  41.3 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2408  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1419  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 
74 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  28.38 
 
 
76 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949058  normal  0.642799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>