111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2051 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
72 aa  145  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  68.66 
 
 
68 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  77.78 
 
 
76 aa  96.7  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  69.7 
 
 
71 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  67.16 
 
 
68 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  76.19 
 
 
68 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  68.18 
 
 
66 aa  92  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  69.23 
 
 
65 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  69.84 
 
 
66 aa  87  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  69.84 
 
 
66 aa  87  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  69.84 
 
 
66 aa  87  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  58.21 
 
 
68 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  68.25 
 
 
67 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3415  4-oxalocrotonate tautomerase  67.16 
 
 
74 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  58.46 
 
 
69 aa  84  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  65.67 
 
 
71 aa  84  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  68.25 
 
 
67 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  66.15 
 
 
67 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  61.54 
 
 
67 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  60 
 
 
67 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  65.08 
 
 
67 aa  82  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  64.62 
 
 
67 aa  81.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  66.15 
 
 
67 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  66.15 
 
 
67 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  66.15 
 
 
67 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  64.62 
 
 
67 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  61.9 
 
 
67 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  58.82 
 
 
68 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  57.58 
 
 
81 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  55.38 
 
 
69 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2346  4-oxalocrotonate tautomerase  57.35 
 
 
73 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  58.46 
 
 
72 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  55.38 
 
 
69 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  60.32 
 
 
67 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1472  hypothetical protein  55.07 
 
 
71 aa  73.6  0.0000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  52.31 
 
 
73 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  50.7 
 
 
72 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3995  4-oxalocrotonate tautomerase  53.85 
 
 
72 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  52.11 
 
 
76 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  58.73 
 
 
78 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  48.61 
 
 
73 aa  64.7  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4145  4-oxalocrotonate tautomerase  51.39 
 
 
78 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.711569  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0857  hypothetical protein  47.69 
 
 
76 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  51.39 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0818  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  48.65 
 
 
76 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  48.39 
 
 
61 aa  60.1  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3914  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6827  4-oxalocrotonate tautomerase  45.21 
 
 
78 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
62 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1805  4-oxalocrotonate tautomerase  47.37 
 
 
61 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2113  hypothetical protein  48.44 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0297  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  43.08 
 
 
68 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0319  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  41.54 
 
 
68 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1700  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  40 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 
61 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1403  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  36.92 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  41.94 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3312  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
68 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0859  hypothetical protein  29.69 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1419  4-oxalocrotonate tautomerase  40.28 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910696 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1993  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1308  4-oxalocrotonate tautomerase  38.03 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_003296  RS02204  hypothetical protein  36.07 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2498  4-oxalocrotonate tautomerase  37.29 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0252029  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4901  4-oxalocrotonate tautomerase  30.56 
 
 
72 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3262  4-oxalocrotonate tautomerase  30.56 
 
 
72 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3818  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.275708  normal  0.0206899 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0702  putative isomerase  39.29 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.995375  normal  0.17203 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3617  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629202  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949058  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.32 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
70 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1150  4-oxalocrotonate tautomerase  37.29 
 
 
132 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
63 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3427  4-oxalocrotonate tautomerase  29.17 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3523  4-oxalocrotonate tautomerase  35.59 
 
 
128 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0522964 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.71 
 
 
63 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.71 
 
 
63 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.66 
 
 
69 aa  41.2  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0325  putative tautomerase  32.2 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.483341  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>