47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1419 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1419  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 74 aa  149  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4689  4-oxalocrotonate tautomerase  62.86 
 
 		 70 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.091228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5607  4-oxalocrotonate tautomerase  62.86 
 
 		 70 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4257  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  55.56 
 
 		 72 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4901  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 72 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3262  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 72 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4438  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 72 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3427  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 72 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2693  4-oxalocrotonate tautomerase  48.57 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.46733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3312  4-oxalocrotonate tautomerase  43.55 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1993  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130331 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949058  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1900  hypothetical protein  37.29 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0528979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1308  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.94 
 
 		 76 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  39.13 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  40.28 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.98 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4665  4-oxalocrotonate tautomerase  32.31 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.11 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4696  4-oxalocrotonate tautomerase  30.88 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194693  hitchhiker  0.00079321 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.48 
 
 		 67 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  37.1 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.1 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.07 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.98 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.98 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.6 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4574  hypothetical protein  32.81 
 
 		 177 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  35.94 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.11 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.06 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.35 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  36.07 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.34 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 		 68 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  38.89 
 
 		 76 aa  40  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>