46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4257 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4257  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  100 
 
 		 72 aa  144  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4438  4-oxalocrotonate tautomerase  63.89 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3427  4-oxalocrotonate tautomerase  62.5 
 
 		 72 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3262  4-oxalocrotonate tautomerase  62.5 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4901  4-oxalocrotonate tautomerase  62.5 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5607  4-oxalocrotonate tautomerase  60 
 
 		 70 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4689  4-oxalocrotonate tautomerase  58.57 
 
 		 70 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.091228  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1419  4-oxalocrotonate tautomerase  55.56 
 
 		 74 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910696 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2693  4-oxalocrotonate tautomerase  44.29 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.46733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1900  hypothetical protein  39.73 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0528979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3312  4-oxalocrotonate tautomerase  46.03 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4696  4-oxalocrotonate tautomerase  37.68 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194693  hitchhiker  0.00079321 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  41.54 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949058  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1993  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 		 69 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1308  4-oxalocrotonate tautomerase  36.92 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4665  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 		 62 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 		 62 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  42.19 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.94 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.566726  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.5 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2694  putative tautomerase  28.17 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0593084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  40.62 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.62 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.62 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  39.68 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.98 
 
 		 68 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  41.27 
 
 		 67 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5581  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 78 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  39.06 
 
 		 67 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  37.93 
 
 		 61 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.62 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  41.27 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.98 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1805  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 61 aa  40.4  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.94 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 		 66 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>