22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4665 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4665  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
76 aa  157  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  72 
 
 
76 aa  103  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949058  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1993  4-oxalocrotonate tautomerase  70.77 
 
 
69 aa  94.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1308  4-oxalocrotonate tautomerase  57.97 
 
 
70 aa  88.2  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3312  4-oxalocrotonate tautomerase  55.38 
 
 
68 aa  77.8  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2694  putative tautomerase  44.26 
 
 
72 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0593084  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5867  putative tautomerase protein  50.82 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0453525  normal  0.0277582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3427  4-oxalocrotonate tautomerase  44.26 
 
 
72 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5607  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 
70 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3262  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4438  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4901  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4689  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
70 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.091228  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4257  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  36.07 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1419  4-oxalocrotonate tautomerase  32.31 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910696 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  35.38 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.81 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.81 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  30.56 
 
 
71 aa  40.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  32.81 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>