18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4689 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4689  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 70 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.091228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5607  4-oxalocrotonate tautomerase  85.71 
 
 		 70 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1419  4-oxalocrotonate tautomerase  62.86 
 
 		 74 aa  94.4  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910696 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4901  4-oxalocrotonate tautomerase  61.43 
 
 		 72 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3262  4-oxalocrotonate tautomerase  61.43 
 
 		 72 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3427  4-oxalocrotonate tautomerase  61.43 
 
 		 72 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4438  4-oxalocrotonate tautomerase  61.43 
 
 		 72 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4257  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  58.57 
 
 		 72 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2693  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.46733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1900  hypothetical protein  42.62 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0528979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4696  4-oxalocrotonate tautomerase  39.13 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194693  hitchhiker  0.00079321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3312  4-oxalocrotonate tautomerase  39.68 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4665  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1308  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1993  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130331 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949058  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.11 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  34.78 
 
 		 71 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>