36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2370 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 76 aa  155  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949058  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4665  4-oxalocrotonate tautomerase  72 
 
 		 76 aa  103  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1993  4-oxalocrotonate tautomerase  73.85 
 
 		 69 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1308  4-oxalocrotonate tautomerase  60 
 
 		 70 aa  90.1  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3312  4-oxalocrotonate tautomerase  57.35 
 
 		 68 aa  88.6  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2694  putative tautomerase  39.34 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0593084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4901  4-oxalocrotonate tautomerase  47.54 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3262  4-oxalocrotonate tautomerase  47.54 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4438  4-oxalocrotonate tautomerase  47.54 
 
 		 72 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5867  putative tautomerase protein  50.94 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0453525  normal  0.0277582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3427  4-oxalocrotonate tautomerase  45.9 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1419  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910696 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4257  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  39.34 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5607  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  32.26 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.79 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4689  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.091228  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.87 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  29.33 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.79 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 66 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 66 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  32.26 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.09 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  31.58 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0857  hypothetical protein  35.59 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  28.38 
 
 		 81 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  29.51 
 
 		 67 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>