64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0762 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
69 aa  143  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  83.08 
 
 
68 aa  118  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  63.64 
 
 
66 aa  94.7  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  64.71 
 
 
67 aa  94  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  64.71 
 
 
68 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  64.71 
 
 
76 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  63.08 
 
 
68 aa  89.7  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  57.35 
 
 
68 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  57.58 
 
 
67 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  62.12 
 
 
67 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  62.12 
 
 
67 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  61.76 
 
 
71 aa  88.2  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  60.61 
 
 
66 aa  87.8  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  60.61 
 
 
66 aa  87.8  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  60.61 
 
 
66 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3415  4-oxalocrotonate tautomerase  60.61 
 
 
74 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  61.54 
 
 
65 aa  87  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  56.72 
 
 
67 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  61.19 
 
 
67 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  61.19 
 
 
67 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  61.19 
 
 
67 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  61.19 
 
 
67 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  53.85 
 
 
71 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  58.46 
 
 
72 aa  84  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  57.58 
 
 
67 aa  83.6  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  55.38 
 
 
68 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  57.81 
 
 
67 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  55.56 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  57.35 
 
 
67 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  50 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  51.56 
 
 
67 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  50.72 
 
 
73 aa  74.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2346  4-oxalocrotonate tautomerase  52.31 
 
 
73 aa  73.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  47.83 
 
 
69 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  47.83 
 
 
69 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3995  4-oxalocrotonate tautomerase  46.97 
 
 
72 aa  71.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  47.06 
 
 
72 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  47.76 
 
 
73 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  45.59 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  42.86 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1472  hypothetical protein  41.43 
 
 
71 aa  62  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6827  4-oxalocrotonate tautomerase  42.67 
 
 
78 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0818  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.67 
 
 
76 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 
78 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3914  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4145  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
78 aa  57  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.711569  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.32 
 
 
61 aa  54.3  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0857  hypothetical protein  38.46 
 
 
76 aa  52  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0859  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2113  hypothetical protein  35.94 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 
127 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.483341  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4257  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  40.98 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0297  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  32.35 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1900  hypothetical protein  36.84 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0528979  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4438  4-oxalocrotonate tautomerase  35.82 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3427  4-oxalocrotonate tautomerase  35.82 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3262  4-oxalocrotonate tautomerase  35.82 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4901  4-oxalocrotonate tautomerase  35.82 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  30.91 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0319  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  31.82 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4665  4-oxalocrotonate tautomerase  35.38 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1700  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  27.94 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>