53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1991 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
61 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0702  putative isomerase  70.49 
 
 
61 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.995375  normal  0.17203 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  62.3 
 
 
62 aa  89.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1805  4-oxalocrotonate tautomerase  66.1 
 
 
61 aa  85.5  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  48.33 
 
 
61 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  46.43 
 
 
73 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 
72 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 
72 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3818  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.275708  normal  0.0206899 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.09 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2113  hypothetical protein  43.55 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
71 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.566726  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
69 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  32.2 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  32.2 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3030  4-oxalocrotonate tautomerase  32.2 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6264  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113457  normal  0.380962 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  34.92 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2466  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3617  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629202  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  35.29 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2946  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645958  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2498  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0252029  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3523  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0522964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0829  4-oxalocrotonate tautomerase  32.76 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0810  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267524  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0208  4-oxalocrotonate tautomerase  31.03 
 
 
59 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4257  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  37.93 
 
 
72 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5861  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
64 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.314351 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4596  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
65 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  33.9 
 
 
69 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  33.9 
 
 
69 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1084  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00458844  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5353  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167902  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2180  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5081  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.218107 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1079  4-oxalocrotonate tautomerase  31.58 
 
 
60 aa  40.4  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.222536  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0593  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  30.91 
 
 
62 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  30.91 
 
 
62 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>