55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1270 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 62 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1805  4-oxalocrotonate tautomerase  72.41 
 
 		 61 aa  94  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0702  putative isomerase  68.85 
 
 		 61 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.995375  normal  0.17203 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  62.3 
 
 		 61 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  46.67 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.86 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  44.64 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  41.07 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.566726  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3415  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  37.93 
 
 		 69 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  37.93 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3818  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 		 76 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.275708  normal  0.0206899 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.07 
 
 		 68 aa  47.4  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.5 
 
 		 76 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.11 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0208  4-oxalocrotonate tautomerase  33.9 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1079  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 60 aa  45.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.222536  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  36.21 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2113  hypothetical protein  41.07 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.29 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  34.43 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2946  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  30.91 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2346  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0829  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.5 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.5 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1084  4-oxalocrotonate tautomerase  31.58 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00458844  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0593  4-oxalocrotonate tautomerase  38.3 
 
 		 61 aa  41.2  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.09 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6264  4-oxalocrotonate tautomerase  27.42 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113457  normal  0.380962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4257  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  33.33 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  30 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0020  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.71 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>