69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1640 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  100 
 
 
67 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  77.61 
 
 
67 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  78.79 
 
 
67 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  78.79 
 
 
67 aa  107  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  73.13 
 
 
67 aa  102  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  74.24 
 
 
67 aa  100  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  72.73 
 
 
67 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  71.64 
 
 
67 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  71.21 
 
 
67 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  71.21 
 
 
67 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  71.21 
 
 
67 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  66.67 
 
 
67 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  76.56 
 
 
76 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  68.66 
 
 
67 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  71.64 
 
 
68 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  70.77 
 
 
71 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  70.31 
 
 
66 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  70.31 
 
 
66 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  70.31 
 
 
66 aa  92  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  70.31 
 
 
66 aa  91.3  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  61.19 
 
 
68 aa  89.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  68.75 
 
 
68 aa  87.8  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  65.62 
 
 
65 aa  87.8  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  58.21 
 
 
68 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  63.49 
 
 
81 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  65.15 
 
 
76 aa  85.1  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  59.38 
 
 
71 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  58.21 
 
 
68 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  57.81 
 
 
69 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2346  4-oxalocrotonate tautomerase  63.49 
 
 
73 aa  79.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  58.21 
 
 
69 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  61.9 
 
 
72 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3415  4-oxalocrotonate tautomerase  63.08 
 
 
74 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  58.21 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1472  hypothetical protein  56.06 
 
 
71 aa  75.5  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  51.52 
 
 
72 aa  73.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 
69 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3995  4-oxalocrotonate tautomerase  46.97 
 
 
72 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  47.89 
 
 
73 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 
72 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0818  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  47.3 
 
 
76 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  49.3 
 
 
78 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  46.88 
 
 
73 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0857  hypothetical protein  43.08 
 
 
76 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6827  4-oxalocrotonate tautomerase  45.83 
 
 
78 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  45.83 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3914  4-oxalocrotonate tautomerase  45.83 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4145  4-oxalocrotonate tautomerase  45.83 
 
 
78 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.711569  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2113  hypothetical protein  40.62 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.33 
 
 
61 aa  50.4  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0859  hypothetical protein  29.85 
 
 
67 aa  50.4  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1993  4-oxalocrotonate tautomerase  35.82 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3312  4-oxalocrotonate tautomerase  34.92 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949058  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0297  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  37.7 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0319  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  37.7 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02204  hypothetical protein  32.26 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1419  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
127 aa  42.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.483341  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1700  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  34.43 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1308  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
70 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
61 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4924  4-oxalocrotonate tautomerase  30.43 
 
 
130 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3847  4-oxalocrotonate tautomerase  30.43 
 
 
130 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.544573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1900  hypothetical protein  36.21 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0528979  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4257  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  35.94 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>