22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2504 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 71 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.566726  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1805  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 		 62 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0702  putative isomerase  37.7 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.995375  normal  0.17203 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  33.9 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.9 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.9 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0609  4-oxalocrotonate tautomerase  38.3 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.869247 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.87 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  32.2 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4257  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  36.36 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  32.2 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2036  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.1 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0593  4-oxalocrotonate tautomerase  35.42 
 
 		 61 aa  41.2  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  33.9 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  32.26 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1900  hypothetical protein  30.26 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0528979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3030  4-oxalocrotonate tautomerase  33.85 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  30.65 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  32.84 
 
 		 69 aa  40  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>