83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1584 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 66 aa  130  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  68.18 
 
 		 67 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  73.44 
 
 		 67 aa  96.7  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  69.7 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  63.64 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  71.88 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  70.77 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  70.77 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  70.77 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  68.18 
 
 		 72 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  72.73 
 
 		 68 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  71.21 
 
 		 76 aa  92  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  65.15 
 
 		 68 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  70.31 
 
 		 67 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  66.67 
 
 		 67 aa  90.1  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  68.75 
 
 		 71 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  65.15 
 
 		 67 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  62.12 
 
 		 67 aa  87.8  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  62.9 
 
 		 81 aa  87  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  66.67 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  66.67 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2346  4-oxalocrotonate tautomerase  67.21 
 
 		 73 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  66.67 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  71.67 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  57.58 
 
 		 68 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  66.67 
 
 		 68 aa  84.7  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  60.94 
 
 		 67 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  66.15 
 
 		 65 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  60.66 
 
 		 68 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3415  4-oxalocrotonate tautomerase  59.7 
 
 		 74 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  56.92 
 
 		 71 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  65 
 
 		 72 aa  80.5  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  56.52 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  58.21 
 
 		 73 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  56.52 
 
 		 69 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1472  hypothetical protein  52.94 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3995  4-oxalocrotonate tautomerase  52.31 
 
 		 72 aa  70.5  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  53.57 
 
 		 72 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  53.57 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  53.97 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  46.15 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0857  hypothetical protein  47.54 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3914  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  48.21 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0818  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  47.22 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6827  4-oxalocrotonate tautomerase  47.3 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4145  4-oxalocrotonate tautomerase  45.83 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.711569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1805  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0297  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  42.62 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0319  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  42.62 
 
 		 68 aa  50.1  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2113  hypothetical protein  40.62 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 62 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1700  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  37.88 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1900  hypothetical protein  37.93 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0528979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.33 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3312  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0859  hypothetical protein  29.85 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1993  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130331 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3818  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.275708  normal  0.0206899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.483341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4257  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  39.68 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5607  4-oxalocrotonate tautomerase  34.33 
 
 		 70 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.566726  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1403  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  32.2 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3427  4-oxalocrotonate tautomerase  32.35 
 
 		 72 aa  40  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  37.5 
 
 		 63 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>