83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1455 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  152  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  84.85 
 
 
69 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  83.33 
 
 
69 aa  110  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1472  hypothetical protein  69.7 
 
 
71 aa  95.5  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  59.42 
 
 
67 aa  89.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  66.67 
 
 
67 aa  87.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  62.32 
 
 
67 aa  87.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  60.61 
 
 
66 aa  87.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  62.86 
 
 
67 aa  87  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  59.09 
 
 
66 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  61.43 
 
 
68 aa  85.5  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  59.09 
 
 
66 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  65.15 
 
 
67 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  57.75 
 
 
71 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  57.97 
 
 
67 aa  85.1  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0857  hypothetical protein  57.89 
 
 
76 aa  84.3  5e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  62.9 
 
 
67 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  57.97 
 
 
67 aa  83.6  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  58.57 
 
 
68 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  60.29 
 
 
76 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  59.09 
 
 
67 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  59.42 
 
 
67 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  59.09 
 
 
67 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  59.09 
 
 
67 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  59.09 
 
 
67 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  56.06 
 
 
65 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  47.83 
 
 
73 aa  74.7  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  49.28 
 
 
68 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3415  4-oxalocrotonate tautomerase  54.55 
 
 
74 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  48.48 
 
 
71 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2346  4-oxalocrotonate tautomerase  51.39 
 
 
73 aa  71.2  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  52.11 
 
 
72 aa  70.1  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  53.85 
 
 
81 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  47.22 
 
 
68 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  46.38 
 
 
68 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0818  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  46.48 
 
 
76 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  53.97 
 
 
66 aa  67.4  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  45.83 
 
 
78 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4145  4-oxalocrotonate tautomerase  43.66 
 
 
78 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.711569  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0859  hypothetical protein  37.68 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  45.07 
 
 
72 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6827  4-oxalocrotonate tautomerase  41.56 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  46.15 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3914  4-oxalocrotonate tautomerase  40.85 
 
 
79 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  46.97 
 
 
73 aa  60.5  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  45.45 
 
 
72 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2113  hypothetical protein  42.42 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.5 
 
 
61 aa  57.4  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 
78 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3995  4-oxalocrotonate tautomerase  40.91 
 
 
72 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3818  4-oxalocrotonate tautomerase  44.44 
 
 
76 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.275708  normal  0.0206899 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
61 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3312  4-oxalocrotonate tautomerase  39.68 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0319  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  32.35 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0297  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  32.35 
 
 
68 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3030  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1700  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  35.29 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  35.82 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1308  4-oxalocrotonate tautomerase  38.36 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1403  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  32.31 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.33 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  36.21 
 
 
62 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  30.16 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  30.16 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  30.16 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  30.16 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  30.16 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  30.16 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  30.16 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  30.16 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  30.16 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  30.16 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  30.16 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
63 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  38 
 
 
63 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  34.48 
 
 
63 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2180  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4696  4-oxalocrotonate tautomerase  34.92 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194693  hitchhiker  0.00079321 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1743  4-oxalocrotonate tautomerase  32.31 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0439637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  32.81 
 
 
63 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1419  4-oxalocrotonate tautomerase  38.89 
 
 
74 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>