59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3281 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 73 aa  147  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  50.68 
 
 		 69 aa  83.6  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  57.75 
 
 		 68 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  57.97 
 
 		 66 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  57.97 
 
 		 66 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  57.97 
 
 		 66 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  50.68 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  57.14 
 
 		 67 aa  80.5  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2346  4-oxalocrotonate tautomerase  55.56 
 
 		 73 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3415  4-oxalocrotonate tautomerase  50.68 
 
 		 74 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  54.17 
 
 		 71 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  49.32 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  53.52 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  48.61 
 
 		 68 aa  76.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  54.79 
 
 		 67 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  58.21 
 
 		 66 aa  75.1  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  49.3 
 
 		 67 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  50.72 
 
 		 69 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  47.83 
 
 		 76 aa  74.7  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  52.05 
 
 		 67 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  50.7 
 
 		 68 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  52.78 
 
 		 71 aa  73.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  52.05 
 
 		 76 aa  72  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  52.11 
 
 		 67 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  53.42 
 
 		 67 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1472  hypothetical protein  48.61 
 
 		 71 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  50.72 
 
 		 67 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 68 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  52.05 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  52.05 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  52.05 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  50.72 
 
 		 72 aa  71.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  53.62 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  49.28 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3995  4-oxalocrotonate tautomerase  46.38 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  47.95 
 
 		 67 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  47.89 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0857  hypothetical protein  42.03 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  48.61 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0818  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  49.32 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4145  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.711569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  55.56 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  47.22 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3914  4-oxalocrotonate tautomerase  44.44 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6827  4-oxalocrotonate tautomerase  44.44 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  31.94 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.71 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  34.78 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1308  4-oxalocrotonate tautomerase  39.73 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0859  hypothetical protein  32.39 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3691  hypothetical protein  40 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.205332 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0310  hypothetical protein  31.88 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3312  4-oxalocrotonate tautomerase  41.27 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02204  hypothetical protein  31.82 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2951  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 		 59 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>