53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1320 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 132 aa  255  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  47.62 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.483341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3691  hypothetical protein  45.67 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.205332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4893  hypothetical protein  35.94 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364576  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3911  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4924  4-oxalocrotonate tautomerase  28.79 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3847  4-oxalocrotonate tautomerase  28.79 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.544573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1150  4-oxalocrotonate tautomerase  30.47 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3620  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2880  4-oxalocrotonate tautomerase  31.85 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02204  hypothetical protein  28.91 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4359  4-oxalocrotonate tautomerase  34.56 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3581  4-oxalocrotonate tautomerase  32.03 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1169  4-oxalocrotonate tautomerase  32.06 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1769  4-oxalocrotonate tautomerase  32.03 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0159397  normal  0.0361346 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3464  4-oxalocrotonate tautomerase  30.88 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560795 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0717  hypothetical protein  31.82 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.132967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4629  4-oxalocrotonate tautomerase  34.26 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  36.92 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3914  4-oxalocrotonate tautomerase  43.08 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  44.12 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  35.82 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4145  4-oxalocrotonate tautomerase  42.19 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.711569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  34.85 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3080  4-oxalocrotonate tautomerase  30.15 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  36.11 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  31.67 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0818  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.6 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6827  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  36.67 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  31.67 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  31.67 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 69 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  40 
 
 		 71 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  30.88 
 
 		 68 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  39.06 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  29.23 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  34.38 
 
 		 69 aa  40.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2113  hypothetical protein  32.2 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>