19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3691 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3691  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  282  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.205332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  45 
 
 		 132 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  39.2 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.483341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1769  4-oxalocrotonate tautomerase  30.47 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0159397  normal  0.0361346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1169  4-oxalocrotonate tautomerase  29.23 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02204  hypothetical protein  28.35 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3847  4-oxalocrotonate tautomerase  26.77 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.544573 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4924  4-oxalocrotonate tautomerase  26.77 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3911  4-oxalocrotonate tautomerase  30.25 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2880  4-oxalocrotonate tautomerase  29.13 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3620  4-oxalocrotonate tautomerase  30.25 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1150  4-oxalocrotonate tautomerase  28.68 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3464  4-oxalocrotonate tautomerase  28.57 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4893  hypothetical protein  28.95 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364576  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0717  hypothetical protein  29.69 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.132967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4629  4-oxalocrotonate tautomerase  32.8 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4359  4-oxalocrotonate tautomerase  24.41 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3080  4-oxalocrotonate tautomerase  27.13 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>