19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4359 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4359  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 132 aa  270  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3464  4-oxalocrotonate tautomerase  75 
 
 		 143 aa  206  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560795 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2880  4-oxalocrotonate tautomerase  62.5 
 
 		 130 aa  171  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3080  4-oxalocrotonate tautomerase  58.46 
 
 		 132 aa  158  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3847  4-oxalocrotonate tautomerase  51.54 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.544573 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4924  4-oxalocrotonate tautomerase  51.54 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02204  hypothetical protein  49.22 
 
 		 140 aa  136  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0717  hypothetical protein  46.56 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.132967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4629  4-oxalocrotonate tautomerase  52.42 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1150  4-oxalocrotonate tautomerase  43.85 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1169  4-oxalocrotonate tautomerase  48.03 
 
 		 135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1769  4-oxalocrotonate tautomerase  44.09 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0159397  normal  0.0361346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4893  hypothetical protein  42.11 
 
 		 142 aa  93.2  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364576  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3581  4-oxalocrotonate tautomerase  39.84 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3620  4-oxalocrotonate tautomerase  40.46 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3911  4-oxalocrotonate tautomerase  39.69 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  29.69 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.483341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  34.38 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3691  hypothetical protein  24.41 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.205332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>