19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3080 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3080  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 132 aa  272  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2880  4-oxalocrotonate tautomerase  72.73 
 
 		 130 aa  197  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4359  4-oxalocrotonate tautomerase  58.46 
 
 		 132 aa  158  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3464  4-oxalocrotonate tautomerase  56.15 
 
 		 143 aa  153  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560795 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4629  4-oxalocrotonate tautomerase  56.35 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3847  4-oxalocrotonate tautomerase  46.21 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.544573 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4924  4-oxalocrotonate tautomerase  46.21 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0717  hypothetical protein  47.73 
 
 		 131 aa  130  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.132967 
 
 
-
 
NC_003296  RS02204  hypothetical protein  47.33 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1150  4-oxalocrotonate tautomerase  46.51 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1769  4-oxalocrotonate tautomerase  47.73 
 
 		 135 aa  120  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0159397  normal  0.0361346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1169  4-oxalocrotonate tautomerase  44.96 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4893  hypothetical protein  38.46 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364576  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3581  4-oxalocrotonate tautomerase  37.69 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3911  4-oxalocrotonate tautomerase  32.56 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3620  4-oxalocrotonate tautomerase  32.56 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  30.83 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.483341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3691  hypothetical protein  27.13 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.205332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  30.71 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>