34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02204 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02204  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  290  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3847  4-oxalocrotonate tautomerase  89.15 
 
 		 130 aa  242  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.544573 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4924  4-oxalocrotonate tautomerase  89.15 
 
 		 130 aa  242  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1150  4-oxalocrotonate tautomerase  67.72 
 
 		 132 aa  179  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2880  4-oxalocrotonate tautomerase  55.04 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1769  4-oxalocrotonate tautomerase  51.91 
 
 		 135 aa  140  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0159397  normal  0.0361346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4359  4-oxalocrotonate tautomerase  49.22 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3080  4-oxalocrotonate tautomerase  47.33 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1169  4-oxalocrotonate tautomerase  51.18 
 
 		 135 aa  120  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0717  hypothetical protein  40.62 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.132967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4893  hypothetical protein  43.75 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364576  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3464  4-oxalocrotonate tautomerase  42.97 
 
 		 143 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560795 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4629  4-oxalocrotonate tautomerase  45.16 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3581  4-oxalocrotonate tautomerase  43.75 
 
 		 143 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3911  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3620  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 134 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3691  hypothetical protein  28.35 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.205332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  34.38 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.483341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  28.23 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  33.9 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.26 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  34.85 
 
 		 69 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  32.26 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  34.92 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  30.3 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  28.79 
 
 		 67 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  31.25 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  31.34 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  32.31 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.31 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.79 
 
 		 73 aa  40.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  31.82 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>