21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3620 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3620  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 134 aa  276  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3911  4-oxalocrotonate tautomerase  99.25 
 
 		 134 aa  274  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4893  hypothetical protein  44.78 
 
 		 142 aa  124  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364576  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3581  4-oxalocrotonate tautomerase  49.23 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1769  4-oxalocrotonate tautomerase  42.19 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0159397  normal  0.0361346 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3847  4-oxalocrotonate tautomerase  39.69 
 
 		 130 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.544573 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4924  4-oxalocrotonate tautomerase  39.69 
 
 		 130 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02204  hypothetical protein  37.5 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1169  4-oxalocrotonate tautomerase  40.62 
 
 		 135 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1150  4-oxalocrotonate tautomerase  32.33 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2880  4-oxalocrotonate tautomerase  37.01 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4359  4-oxalocrotonate tautomerase  40.46 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3464  4-oxalocrotonate tautomerase  39.37 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560795 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0717  hypothetical protein  32.81 
 
 		 131 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.132967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4629  4-oxalocrotonate tautomerase  36.44 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3080  4-oxalocrotonate tautomerase  32.56 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3691  hypothetical protein  30.25 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.205332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  31.25 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.483341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  31.67 
 
 		 67 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>