36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3847 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3847  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 130 aa  266  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.544573 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4924  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 130 aa  266  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02204  hypothetical protein  89.15 
 
 		 140 aa  242  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1150  4-oxalocrotonate tautomerase  70.87 
 
 		 132 aa  186  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2880  4-oxalocrotonate tautomerase  56.15 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1769  4-oxalocrotonate tautomerase  55.12 
 
 		 135 aa  146  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0159397  normal  0.0361346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4359  4-oxalocrotonate tautomerase  51.54 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3080  4-oxalocrotonate tautomerase  46.21 
 
 		 132 aa  130  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1169  4-oxalocrotonate tautomerase  54.33 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4893  hypothetical protein  46.88 
 
 		 142 aa  123  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364576  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3581  4-oxalocrotonate tautomerase  48.44 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3464  4-oxalocrotonate tautomerase  44.62 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560795 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0717  hypothetical protein  40.77 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.132967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4629  4-oxalocrotonate tautomerase  47.69 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3911  4-oxalocrotonate tautomerase  39.69 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3620  4-oxalocrotonate tautomerase  39.69 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  33.59 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.483341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3691  hypothetical protein  26.77 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.205332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  28.23 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.8 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  32.26 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  32.26 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  35.38 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  34.43 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.35 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  32.35 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.35 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  32.2 
 
 		 66 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  30.43 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.38 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  30.51 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  32.31 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  30.51 
 
 		 66 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  30.51 
 
 		 66 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.14 
 
 		 68 aa  40  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>