19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4629 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4629  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 132 aa  272  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0717  hypothetical protein  61.36 
 
 		 131 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.132967 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2880  4-oxalocrotonate tautomerase  58.87 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3080  4-oxalocrotonate tautomerase  56.35 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4359  4-oxalocrotonate tautomerase  52.42 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1150  4-oxalocrotonate tautomerase  45.16 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3847  4-oxalocrotonate tautomerase  47.69 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.544573 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4924  4-oxalocrotonate tautomerase  47.69 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3464  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560795 
 
 
-
 
NC_003296  RS02204  hypothetical protein  45.16 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1169  4-oxalocrotonate tautomerase  43.2 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1769  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0159397  normal  0.0361346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4893  hypothetical protein  39.2 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364576  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3581  4-oxalocrotonate tautomerase  41.27 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3620  4-oxalocrotonate tautomerase  36.44 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3911  4-oxalocrotonate tautomerase  35.59 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3691  hypothetical protein  32.8 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.205332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  33.66 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  28 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.483341  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>