29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3581 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3581  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4893  hypothetical protein  58.52 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364576  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3911  4-oxalocrotonate tautomerase  49.23 
 
 		 134 aa  133  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1769  4-oxalocrotonate tautomerase  50.74 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0159397  normal  0.0361346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3620  4-oxalocrotonate tautomerase  49.23 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1150  4-oxalocrotonate tautomerase  48.06 
 
 		 132 aa  130  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4924  4-oxalocrotonate tautomerase  48.44 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3847  4-oxalocrotonate tautomerase  48.44 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.544573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1169  4-oxalocrotonate tautomerase  52.94 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02204  hypothetical protein  43.75 
 
 		 140 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2880  4-oxalocrotonate tautomerase  41.41 
 
 		 130 aa  100  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4359  4-oxalocrotonate tautomerase  39.84 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0717  hypothetical protein  39.47 
 
 		 131 aa  90.5  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.132967 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3080  4-oxalocrotonate tautomerase  37.69 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4629  4-oxalocrotonate tautomerase  41.27 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3464  4-oxalocrotonate tautomerase  40.62 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  32.81 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.483341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  30.65 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3691  hypothetical protein  28.69 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.205332 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  32.2 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  30.3 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  31.67 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  28.33 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  29.03 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  29.03 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  26.56 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  26.67 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  28.33 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  27.87 
 
 		 66 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>