72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0855 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 67 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  77.61 
 
 		 67 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  70.15 
 
 		 67 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  72.73 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  72.73 
 
 		 67 aa  99.4  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  71.64 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  69.7 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  71.21 
 
 		 67 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  71.21 
 
 		 67 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  71.21 
 
 		 67 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  67.16 
 
 		 68 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  70.31 
 
 		 71 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  67.69 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  65.62 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  69.23 
 
 		 71 aa  94  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  68.18 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  64.18 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  66.15 
 
 		 66 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  66.15 
 
 		 66 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  66.67 
 
 		 76 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  65.62 
 
 		 68 aa  89.7  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  65.08 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2346  4-oxalocrotonate tautomerase  73.21 
 
 		 73 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  55.22 
 
 		 68 aa  84.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3415  4-oxalocrotonate tautomerase  67.69 
 
 		 74 aa  84.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  60.94 
 
 		 66 aa  83.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  59.42 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  60.29 
 
 		 68 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  59.38 
 
 		 65 aa  80.5  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  60.32 
 
 		 69 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  56.06 
 
 		 72 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3995  4-oxalocrotonate tautomerase  53.03 
 
 		 72 aa  77  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  56.06 
 
 		 69 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  56.72 
 
 		 68 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  51.56 
 
 		 69 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  56.06 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  57.81 
 
 		 72 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  60.32 
 
 		 72 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  56.25 
 
 		 73 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1472  hypothetical protein  51.52 
 
 		 71 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  53.52 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0857  hypothetical protein  43.08 
 
 		 76 aa  67  0.00000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  47.95 
 
 		 73 aa  66.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0818  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  50 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6827  4-oxalocrotonate tautomerase  47.89 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3914  4-oxalocrotonate tautomerase  46.48 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  46.48 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4145  4-oxalocrotonate tautomerase  47.89 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.711569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.11 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2113  hypothetical protein  38.46 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1700  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  35.59 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1403  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  30.3 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0859  hypothetical protein  26.87 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0319  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  37.29 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0297  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  37.29 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3620  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3847  4-oxalocrotonate tautomerase  35.38 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.544573 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4924  4-oxalocrotonate tautomerase  35.38 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3911  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3427  4-oxalocrotonate tautomerase  34.33 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3262  4-oxalocrotonate tautomerase  35.82 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4901  4-oxalocrotonate tautomerase  35.82 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4438  4-oxalocrotonate tautomerase  34.33 
 
 		 72 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 62 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  34.92 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  32.26 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  31.75 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  31.25 
 
 		 71 aa  40  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1308  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 70 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  29.51 
 
 		 76 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949058  normal  0.642799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>