68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0469 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  138  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  98.55 
 
 
69 aa  136  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  84.85 
 
 
76 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1472  hypothetical protein  69.7 
 
 
71 aa  97.8  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  60.87 
 
 
67 aa  87.8  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  59.09 
 
 
66 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  58.46 
 
 
67 aa  84  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  57.58 
 
 
66 aa  83.6  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  57.58 
 
 
66 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  50.68 
 
 
73 aa  83.6  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  59.42 
 
 
67 aa  82  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  59.7 
 
 
67 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  57.97 
 
 
67 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3415  4-oxalocrotonate tautomerase  55.07 
 
 
74 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  59.09 
 
 
68 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  53.62 
 
 
81 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  57.58 
 
 
67 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2346  4-oxalocrotonate tautomerase  58.57 
 
 
73 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  59.09 
 
 
76 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  56.06 
 
 
71 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0857  hypothetical protein  52.31 
 
 
76 aa  78.6  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  56.72 
 
 
68 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  57.97 
 
 
67 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  57.97 
 
 
67 aa  77.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  57.97 
 
 
67 aa  77.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  57.97 
 
 
67 aa  77.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  58.21 
 
 
67 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  54.55 
 
 
67 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  55.38 
 
 
72 aa  77  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  49.28 
 
 
71 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  56.06 
 
 
67 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  56.52 
 
 
66 aa  75.1  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  48.53 
 
 
68 aa  73.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  47.83 
 
 
69 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  46.27 
 
 
68 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0818  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.47 
 
 
76 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6827  4-oxalocrotonate tautomerase  43.24 
 
 
78 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  46.15 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  44.78 
 
 
72 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4145  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 
78 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.711569  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  43.24 
 
 
78 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  46.97 
 
 
72 aa  62.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3914  4-oxalocrotonate tautomerase  39.73 
 
 
79 aa  62  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  45.45 
 
 
73 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3995  4-oxalocrotonate tautomerase  43.94 
 
 
72 aa  60.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0859  hypothetical protein  37.31 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
78 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  39.13 
 
 
69 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2113  hypothetical protein  42.42 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.71 
 
 
61 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0297  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  38.46 
 
 
68 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0319  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  38.46 
 
 
68 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1403  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  36.92 
 
 
68 aa  50.4  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1700  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  40 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3818  4-oxalocrotonate tautomerase  46.55 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.275708  normal  0.0206899 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  37.93 
 
 
62 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1542  4-oxalocrotonate tautomerase  39.68 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000358699  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3312  4-oxalocrotonate tautomerase  35.94 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3030  4-oxalocrotonate tautomerase  34.33 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1769  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0159397  normal  0.0361346 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.87 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  33.9 
 
 
61 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1900  hypothetical protein  31.25 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0528979  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1308  4-oxalocrotonate tautomerase  34.92 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1805  4-oxalocrotonate tautomerase  32.2 
 
 
61 aa  40  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  32.84 
 
 
71 aa  40  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.566726  normal  0.630838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>