54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3818 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3818  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
76 aa  150  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.275708  normal  0.0206899 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0702  putative isomerase  40.98 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.995375  normal  0.17203 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.33 
 
 
61 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1805  4-oxalocrotonate tautomerase  41.38 
 
 
61 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  44.44 
 
 
76 aa  50.8  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  46.55 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  46.55 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
62 aa  47.8  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  45.16 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2346  4-oxalocrotonate tautomerase  45 
 
 
73 aa  47.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  45.16 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.14 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.7 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  33.82 
 
 
69 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 
72 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  39.13 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1472  hypothetical protein  41.38 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.75 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.34 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  39.29 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  44.64 
 
 
67 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  44.64 
 
 
67 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  44.64 
 
 
67 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1290  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 
67 aa  42  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 
71 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.67 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
68 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2113  hypothetical protein  38.71 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0911  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43002  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1186  4-oxalocrotonate tautomerase  34.33 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.13377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  42.19 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>