17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1542 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1542  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
66 aa  131  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000358699  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1743  4-oxalocrotonate tautomerase  54.24 
 
 
64 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0439637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1510  4-oxalocrotonate tautomerase  49.18 
 
 
61 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.258565  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0009  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 
63 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.235995  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0719  4-oxalocrotonate tautomerase  49.12 
 
 
64 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.5068  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0159  4-oxalocrotonate tautomerase  49.12 
 
 
64 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0523793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2180  4-oxalocrotonate tautomerase  55.93 
 
 
63 aa  57  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2466  4-oxalocrotonate tautomerase  45.76 
 
 
61 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3030  4-oxalocrotonate tautomerase  39.66 
 
 
67 aa  52.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0079  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  41.94 
 
 
62 aa  51.6  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000137411  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1055  4-oxalocrotonate tautomerase  43.1 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0810  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267524  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  39.68 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  39.68 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2976  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.854525 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3617  4-oxalocrotonate tautomerase  44.19 
 
 
128 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629202  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>